159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1461 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  100 
 
 		 92 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  98.91 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  96.74 
 
 		 92 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  67.78 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  64.44 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  64.44 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  64.44 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  62.22 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  62.22 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  63.33 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  63.33 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  60 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  64.44 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  56.67 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  62.22 
 
 		 97 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  50 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  62.22 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  56.67 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  54.44 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  44.44 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  47.31 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  43.01 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  47.62 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  37.36 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  37.76 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  38.78 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  34.69 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  40.43 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  36.73 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  34.69 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  37.36 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  37.76 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  36.26 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  35.16 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  34.69 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  37.76 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  32.65 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  32.99 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  32.99 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  40.48 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  33.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  32.98 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  31.96 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  38.14 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  35.71 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  30.93 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  32.99 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  34.69 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  31.96 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  30.68 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  31.96 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  31.96 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  31.96 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  34.69 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  34.69 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  31.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  36 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  31.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  32.99 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  35.96 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  34.07 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0345  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  31.96 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  34.02 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  31.96 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  34.02 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  39.08 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  35.87 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  32.98 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  31.63 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  30.12 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  31.63 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  35.48 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  31.63 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  53.49 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  33.75 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  31.63 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  32.65 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  30.49 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  32.99 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  32.99 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  34.02 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  32.99 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  35.16 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>