More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0562 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  55.87 
 
 
597 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  55.87 
 
 
597 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  55.06 
 
 
597 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  54.25 
 
 
594 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  42.28 
 
 
598 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.86 
 
 
610 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.82 
 
 
593 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  37.86 
 
 
596 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.27 
 
 
607 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  37.45 
 
 
601 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.19 
 
 
605 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.63 
 
 
615 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.51 
 
 
586 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.43 
 
 
624 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.6 
 
 
626 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  40.56 
 
 
610 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.04 
 
 
590 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  41.2 
 
 
618 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  36.55 
 
 
590 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.05 
 
 
604 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  33.75 
 
 
595 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  33.75 
 
 
595 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  29.69 
 
 
601 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.82 
 
 
438 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.71 
 
 
536 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.71 
 
 
536 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.52 
 
 
554 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  29.22 
 
 
538 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  30.8 
 
 
521 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  30.8 
 
 
521 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.19 
 
 
558 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  41.96 
 
 
112 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.62 
 
 
555 aa  95.1  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  28.37 
 
 
557 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  30.86 
 
 
1205 aa  85.9  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.72 
 
 
443 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 
887 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 
930 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 
900 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  32.26 
 
 
882 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.41 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  28.4 
 
 
1186 aa  75.1  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.84 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  29.22 
 
 
846 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  31.82 
 
 
881 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 
1088 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  34.27 
 
 
761 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 
903 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  32.28 
 
 
890 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 
882 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.09 
 
 
447 aa  72  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  30.69 
 
 
911 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 
1085 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  34.9 
 
 
848 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 
893 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  30.25 
 
 
864 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  34.58 
 
 
918 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.6 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.27 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  30.56 
 
 
968 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  31.09 
 
 
896 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 
902 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  32.29 
 
 
884 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 
870 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  35.9 
 
 
896 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  33.85 
 
 
880 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.58 
 
 
792 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 
1014 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  29.76 
 
 
917 aa  68.9  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  25.63 
 
 
793 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 
885 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 
898 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.21 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 
886 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  24.58 
 
 
793 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 
892 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  30.69 
 
 
864 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  30.69 
 
 
868 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  27.87 
 
 
869 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  29.36 
 
 
868 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  28.91 
 
 
851 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 
881 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  28.51 
 
 
945 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  30.5 
 
 
897 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  30.28 
 
 
956 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1181  DNA mismatch repair protein MutS  30.36 
 
 
886 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  29.56 
 
 
872 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 
862 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 
932 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 
858 aa  66.2  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  29.34 
 
 
874 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  32.92 
 
 
931 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 
870 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 
884 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 
884 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 
870 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 
871 aa  65.5  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 
874 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>