More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2594 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2594  ABC transporter related  100 
 
 		 493 aa  967    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  45.51 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.6 
 
 		 501 aa  338  9e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  40.2 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.49 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  39.6 
 
 		 501 aa  336  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.56 
 
 		 503 aa  335  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.49 
 
 		 524 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.82 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  40.24 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  39.84 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.84 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39.84 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.88 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 		 527 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  40 
 
 		 513 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.4 
 
 		 501 aa  332  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.12 
 
 		 507 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 		 523 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 		 523 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  39.79 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 523 aa  329  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.19 
 
 		 516 aa  329  8e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.12 
 
 		 507 aa  329  8e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  41.63 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1140  ABC transporter related  41.3 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40 
 
 		 518 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  42.07 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.45 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.45 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  41.38 
 
 		 517 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  41.38 
 
 		 517 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.45 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.39 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.45 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.45 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  41.25 
 
 		 517 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.57 
 
 		 496 aa  326  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 		 494 aa  326  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 494 aa  326  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 494 aa  326  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.77 
 
 		 499 aa  325  9e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.11 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  39.04 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 517 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.25 
 
 		 501 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  40.25 
 
 		 501 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  39.71 
 
 		 518 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  40.81 
 
 		 517 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  39.84 
 
 		 501 aa  324  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 494 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 506 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39.47 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  38.57 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 502 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  39.27 
 
 		 525 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 523 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  40.68 
 
 		 505 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  37.5 
 
 		 501 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.61 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  40.49 
 
 		 506 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  39.96 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  40.45 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0593  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  37.45 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  41.41 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  38.4 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.06 
 
 		 519 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.96 
 
 		 505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  38.06 
 
 		 501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.53 
 
 		 514 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  38.54 
 
 		 512 aa  320  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 516 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  37.96 
 
 		 496 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 504 aa  319  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 504 aa  319  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 504 aa  319  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 516 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  36.9 
 
 		 525 aa  319  7e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 		 494 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 516 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 499 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.42 
 
 		 507 aa  319  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.4 
 
 		 514 aa  319  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 516 aa  319  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.33 
 
 		 514 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 501 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  40.33 
 
 		 514 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.75 
 
 		 504 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>