More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1706 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  87.77 
 
 		 188 aa  347  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  65.78 
 
 		 187 aa  257  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  54.84 
 
 		 187 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  53.23 
 
 		 186 aa  213  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  53.23 
 
 		 211 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  53.23 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  55.91 
 
 		 187 aa  207  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  51.35 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  53.76 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  50.27 
 
 		 188 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  52.69 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  51.89 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  52.43 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  51.35 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  51.06 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  51.35 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  50.8 
 
 		 188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  50 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  49.73 
 
 		 188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  51.34 
 
 		 188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  49.73 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  51.34 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  51.87 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  48.66 
 
 		 188 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  51.61 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  49.73 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  49.73 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  49.2 
 
 		 188 aa  189  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  48.63 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  49.73 
 
 		 189 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  48.91 
 
 		 187 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  48.91 
 
 		 187 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  49.2 
 
 		 216 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  47.54 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  48.66 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  48.13 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  48.13 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  48.37 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  48.13 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  47.59 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  47.54 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  47.06 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  47.06 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  47.06 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  44.09 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  44.09 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  45.05 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  43.92 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  42.86 
 
 		 189 aa  168  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  46.15 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  42.54 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  41.99 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  45.45 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  38.67 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  40.54 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  37.84 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  37.99 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  39.78 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  38.67 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  39.01 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  39.01 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  38.89 
 
 		 190 aa  140  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  38.04 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  35.68 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  41.21 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  38.8 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  39.44 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  36.26 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  36.26 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  35.91 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  38.33 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  36.67 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  35.91 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  35.91 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  38.67 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  36.52 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  38.12 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  37.57 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  34.97 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  39.34 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  36.41 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  36.11 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  36.46 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  35 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  36.46 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  40.44 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  40.44 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  40.44 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  40.44 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>