50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1559 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 447 aa  885    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  73.74 
 
 		 434 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  75.34 
 
 		 435 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  64.06 
 
 		 445 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  66.15 
 
 		 452 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  62.44 
 
 		 458 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  64.27 
 
 		 451 aa  539  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  65.03 
 
 		 454 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  63.39 
 
 		 453 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  60.71 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  55.78 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  55.78 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  61.2 
 
 		 455 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  55.01 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  56.7 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  54.51 
 
 		 452 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  54.38 
 
 		 452 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  51.02 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  36.94 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  36.77 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  36.92 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  36.07 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  35.28 
 
 		 438 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  36.36 
 
 		 443 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  32.16 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  31.78 
 
 		 430 aa  195  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  31.47 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  33.41 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.28 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  33.72 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  30.47 
 
 		 437 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  31.58 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  33.79 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  32.35 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  32.47 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  31.24 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  32.73 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  33.98 
 
 		 441 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  30.28 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  29 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  29.29 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  29.29 
 
 		 418 aa  116  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  31.04 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  24.94 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  25.44 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  34.56 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  31.06 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  30.59 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  35.04 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>