More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1409 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3083  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  76.42 
 
 
438 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0175697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1409  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
439 aa  880    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1240  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.66 
 
 
435 aa  585  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3600  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.05 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00234742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5465  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.11 
 
 
437 aa  564  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0120  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.58 
 
 
433 aa  564  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.417089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0152  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.13 
 
 
434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.74 
 
 
433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.768224  normal  0.321326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0403  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.36 
 
 
433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236378 
 
 
-
 
NC_004310  BR2079  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.38 
 
 
434 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0308  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.36 
 
 
433 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0257  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.42 
 
 
437 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0302  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.13 
 
 
434 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0418  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.13 
 
 
433 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.06 
 
 
435 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3084  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.05 
 
 
437 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.37 
 
 
435 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0251  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.14 
 
 
435 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600656  normal  0.544782 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1999  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.92 
 
 
434 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0841  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.22 
 
 
434 aa  552  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4311  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.91 
 
 
435 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0624  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.28 
 
 
437 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0656  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.05 
 
 
437 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0031  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.76 
 
 
435 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0645  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.05 
 
 
437 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  0.159408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2296  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.98 
 
 
435 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.238027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3266  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.68 
 
 
435 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3490  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.07 
 
 
436 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.22 
 
 
436 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2559  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.37 
 
 
437 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.358535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2851  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.98 
 
 
436 aa  528  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192992  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.27 
 
 
433 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3441  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.7 
 
 
437 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.37686  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0182  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.27 
 
 
433 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2948  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.04 
 
 
433 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.474337  normal  0.124858 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0997  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.63 
 
 
487 aa  518  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.61 
 
 
435 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0187  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.42 
 
 
438 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0444321  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0805  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.8 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.332648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.8 
 
 
461 aa  504  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04279  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.61 
 
 
485 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1190  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.16 
 
 
437 aa  496  1e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.298692  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.56 
 
 
443 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.31 
 
 
443 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.13 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.56 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.6 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5052  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.43 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42386  normal  0.164562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.74 
 
 
439 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1460  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.07 
 
 
445 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.23 
 
 
440 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2990  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.62 
 
 
446 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  58.67 
 
 
444 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0738  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.73 
 
 
459 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4192  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.3 
 
 
443 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0811  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.01 
 
 
438 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.27 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.84 
 
 
446 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1595  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.82 
 
 
433 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.472132  normal  0.884744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.34 
 
 
440 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0827  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.52 
 
 
459 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.198289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.72 
 
 
443 aa  481  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1585  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.4 
 
 
448 aa  482  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.157035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  57.49 
 
 
443 aa  481  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.61 
 
 
448 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.76 
 
 
447 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00723  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.49 
 
 
443 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.54 
 
 
465 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.6 
 
 
443 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.75 
 
 
441 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2412  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.12 
 
 
445 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.874746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.69 
 
 
440 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000086324 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.97 
 
 
447 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.17 
 
 
446 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.91 
 
 
446 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4560  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.15 
 
 
441 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.43 
 
 
441 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3471  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.65 
 
 
457 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  57.05 
 
 
443 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.27 
 
 
443 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  56.38 
 
 
443 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.38 
 
 
443 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  56.38 
 
 
443 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.38 
 
 
443 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.38 
 
 
443 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0115  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  58.11 
 
 
444 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.928834  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2634  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.93 
 
 
433 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.38 
 
 
443 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0909  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.76 
 
 
442 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2698  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.41 
 
 
438 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.408772  decreased coverage  0.000313907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.27 
 
 
443 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03516  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.62 
 
 
442 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.38 
 
 
443 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.38 
 
 
443 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.18 
 
 
441 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.14 
 
 
441 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.93 
 
 
443 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3838  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.43 
 
 
451 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.672147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.93 
 
 
443 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  55.73 
 
 
441 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>