217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0650 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
315 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  58.18 
 
 
327 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.37 
 
 
327 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.84 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.06 
 
 
327 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  55.17 
 
 
326 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.37 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.92 
 
 
337 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.18 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.08 
 
 
335 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.56 
 
 
332 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.44 
 
 
332 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.08 
 
 
328 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.81 
 
 
332 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.34 
 
 
333 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.14 
 
 
338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.14 
 
 
332 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.99 
 
 
329 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.34 
 
 
335 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.08 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.04 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  45.18 
 
 
341 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.9 
 
 
345 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.24 
 
 
343 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.58 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.45 
 
 
337 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.38 
 
 
340 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
341 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
341 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.67 
 
 
341 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.81 
 
 
346 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  38.39 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.19 
 
 
345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.77 
 
 
347 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.32 
 
 
357 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.12 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.31 
 
 
353 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.39 
 
 
375 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.8 
 
 
346 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
330 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.05 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.1 
 
 
372 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.65 
 
 
327 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.11 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.01 
 
 
771 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.21 
 
 
371 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.42 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.15 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.02 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.35 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.54 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.22 
 
 
325 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.22 
 
 
325 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
331 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.11 
 
 
333 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.04 
 
 
341 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.33 
 
 
331 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.81 
 
 
325 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.67 
 
 
337 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.82 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.59 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.74 
 
 
384 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.6 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  38.73 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  35.91 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.72 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.78 
 
 
333 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.71 
 
 
335 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.56 
 
 
328 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.56 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.56 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.56 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.56 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  33.56 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.05 
 
 
348 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.56 
 
 
328 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.14 
 
 
335 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.56 
 
 
328 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.81 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.74 
 
 
331 aa  108  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.41 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.11 
 
 
360 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.24 
 
 
335 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.72 
 
 
339 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
328 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.56 
 
 
337 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.64 
 
 
366 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
339 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.9 
 
 
335 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.03 
 
 
339 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.24 
 
 
318 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.58 
 
 
345 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.45 
 
 
338 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.87 
 
 
339 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.8 
 
 
331 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.7 
 
 
325 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.39 
 
 
350 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.95 
 
 
335 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>