More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4315 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4315  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.915809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2239  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.98751  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  45.87 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  38.83 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  40.19 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  39.62 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  39.25 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  34.91 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  35.24 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  33.02 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  41.05 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  36.19 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.79 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  34.29 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  34.58 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  36.45 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  38.95 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  38.95 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  40.66 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  35.4 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  37.86 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.83 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  36.45 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  31.86 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  34.95 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  37.36 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  66.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  36.45 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>