More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0834 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  51.02 
 
 		 324 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  39.22 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  38.86 
 
 		 268 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.2 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  32.46 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  36.24 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  33.64 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  30.74 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  34.26 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.79 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  33.62 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  32.14 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  32.68 
 
 		 379 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  40.37 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  33.8 
 
 		 407 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  33.97 
 
 		 408 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  31.02 
 
 		 372 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  32.08 
 
 		 232 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.24 
 
 		 205 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 428 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  39.67 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  32.55 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.73 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  26.7 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.84 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  31.9 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.12 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  30 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  29.46 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.22 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.39 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 846 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 948 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  28.63 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  31.73 
 
 		 781 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.41 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  29.41 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.56 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.41 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.05 
 
 		 185 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  31.75 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  29.41 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.41 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.41 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.41 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.73 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.23 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.23 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.75 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.23 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.75 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.23 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.23 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.23 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>