More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4472 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4472  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  186  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00595179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3916  histone family protein DNA-binding protein  79.57 
 
 		 94 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3718  histone family protein DNA-binding protein  79.35 
 
 		 95 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  67.78 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3371  histone family protein DNA-binding protein  52.27 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.557134  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2507  histone family protein DNA-binding protein  51.61 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.748528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36290  nucleoid DNA-binding protein  52.17 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2752  histone family protein DNA-binding protein  49.46 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 		 93 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0298  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1900  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.785636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  45.45 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1976  nucleoid DNA-binding protein  43.96 
 
 		 93 aa  83.6  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0705  DNA-binding protein HU  42.86 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  42.86 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  42.86 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  42.86 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  42.86 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  42.86 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  43.96 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  42.86 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  41.57 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  41.57 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  42.86 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  41.76 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  41.76 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  43.82 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  40.66 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  39.56 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  44.32 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 232 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  40.66 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  38.2 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  44.09 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  41.57 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  40.45 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  43.18 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  39.53 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  35.96 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  40.66 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  44.32 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  39.56 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  37.08 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  39.33 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0699  integration host factor, alpha subunit  36.26 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101642  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  34.83 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  43.18 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  35.96 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>