More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0386 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  100 
 
 		 340 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  44.32 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.92 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  35.28 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  35.28 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  35.57 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  35.86 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  38.36 
 
 		 365 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  39.54 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.49 
 
 		 362 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  36.95 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.75 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.65 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  35.59 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  44.61 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  38.21 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.46 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.86 
 
 		 394 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  35.42 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.24 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.51 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  40.17 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  43.71 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.86 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  37.94 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.46 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.39 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  38.3 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.28 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  36.49 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  33.05 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  33.63 
 
 		 396 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.31 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  34.47 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.08 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.68 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  38.95 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.13 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  33.24 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  32.22 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  33.45 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  32.29 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.94 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  40.23 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.46 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.85 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.53 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  38.43 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  38.25 
 
 		 361 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  36.48 
 
 		 344 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  37.67 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  35.42 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.14 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  34.15 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3456  hypothetical protein  34.59 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0917683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  32.21 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  33.9 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  33.92 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  32.58 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  35.76 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  36.52 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  37.8 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3865  GTPase EngC  31.76 
 
 		 382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  36.9 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  34.16 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  37.89 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.94 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  34.16 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  37.89 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  37.89 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  37.94 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.29 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  31.27 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  33.44 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.13 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.79 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  36.51 
 
 		 363 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  33.89 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.26 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.38 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  39.92 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  31.91 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.52 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.48 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  33.56 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  32.88 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  32.88 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  32.88 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>