More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0310 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
351 aa  686    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  77.18 
 
 
376 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.44 
 
 
334 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.38 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.41 
 
 
325 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.84 
 
 
321 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.01 
 
 
339 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.38 
 
 
344 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.84 
 
 
333 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.49 
 
 
335 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
595 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  55.66 
 
 
324 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.88 
 
 
388 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.71 
 
 
324 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
608 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  52.61 
 
 
337 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.37 
 
 
344 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.95 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.81 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.97 
 
 
364 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.73 
 
 
341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.97 
 
 
323 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.45 
 
 
312 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01210  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50 
 
 
394 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.67 
 
 
317 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.91 
 
 
372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  54.95 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.54 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53 
 
 
308 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.95 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.63 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  43.28 
 
 
320 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.28 
 
 
320 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.73 
 
 
334 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.72 
 
 
469 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.79 
 
 
356 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.39 
 
 
469 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.54 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.92 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.46 
 
 
470 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  43.31 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.33 
 
 
472 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.85 
 
 
330 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.77 
 
 
473 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.33 
 
 
468 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.61 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  28.8 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.67 
 
 
476 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.9 
 
 
323 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  36.02 
 
 
470 aa  119  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.67 
 
 
326 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.67 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 
682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 
676 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.58 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.68 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  34.94 
 
 
464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  36.52 
 
 
336 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.33 
 
 
324 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  32.47 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  34.48 
 
 
476 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.73 
 
 
470 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.25 
 
 
476 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  31.25 
 
 
476 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.51 
 
 
476 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.7 
 
 
454 aa  106  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.68 
 
 
474 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.08 
 
 
345 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.77 
 
 
241 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.08 
 
 
342 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.5 
 
 
486 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  30.71 
 
 
476 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.83 
 
 
476 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.51 
 
 
476 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.2 
 
 
456 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  30.71 
 
 
476 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  30.71 
 
 
476 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  30.71 
 
 
476 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1743  hypothetical protein  25.35 
 
 
336 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.71 
 
 
476 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.24 
 
 
347 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  35.58 
 
 
326 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.72 
 
 
464 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  38.01 
 
 
442 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.72 
 
 
468 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.96 
 
 
476 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.21 
 
 
469 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00012547  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.68 
 
 
419 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.52 
 
 
457 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  32.62 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.78 
 
 
344 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.54 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.93 
 
 
458 aa  99.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.48 
 
 
462 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.08 
 
 
481 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  36.12 
 
 
444 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18601  ATPase  27.97 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.101709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  34.43 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.43 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.58 
 
 
442 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>