More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1551 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
241 aa  492  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.75 
 
 
509 aa  184  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.04 
 
 
469 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.04 
 
 
469 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.87 
 
 
471 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.56 
 
 
470 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.9 
 
 
456 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.05 
 
 
454 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.81 
 
 
480 aa  151  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  38.12 
 
 
454 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.22 
 
 
492 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.7 
 
 
311 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  35.24 
 
 
476 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.24 
 
 
476 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  35.24 
 
 
476 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.78 
 
 
458 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  35.24 
 
 
476 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  35.24 
 
 
476 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  35.24 
 
 
476 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.24 
 
 
476 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.81 
 
 
476 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.15 
 
 
462 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1289  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.6 
 
 
436 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.35 
 
 
476 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.82 
 
 
481 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.81 
 
 
476 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.05 
 
 
485 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.11 
 
 
459 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.04 
 
 
442 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.49 
 
 
476 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.31 
 
 
472 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.56 
 
 
455 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.5 
 
 
325 aa  142  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.58 
 
 
457 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.05 
 
 
457 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.29 
 
 
470 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  36.45 
 
 
458 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  38.18 
 
 
464 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.57 
 
 
442 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.13 
 
 
436 aa  138  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.93 
 
 
468 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.84 
 
 
414 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  35.47 
 
 
471 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.64 
 
 
457 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.02 
 
 
464 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  36.36 
 
 
443 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.63 
 
 
460 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.56 
 
 
450 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.09 
 
 
468 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.14 
 
 
464 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  35.14 
 
 
470 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.7 
 
 
325 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.18 
 
 
426 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.27 
 
 
462 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.19 
 
 
469 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00012547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.49 
 
 
476 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.79 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1429  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.32 
 
 
334 aa  129  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.88 
 
 
473 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  31.37 
 
 
357 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.29 
 
 
449 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09873  putative cell-cycle protein  36.18 
 
 
436 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  34.85 
 
 
425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.18 
 
 
423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1809  hypothetical protein  35.24 
 
 
472 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.82 
 
 
433 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  33.67 
 
 
445 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.45 
 
 
457 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  33.81 
 
 
449 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.75 
 
 
456 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  32.88 
 
 
332 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.65 
 
 
306 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  32.58 
 
 
476 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1627  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.93 
 
 
335 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  34.18 
 
 
445 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.05 
 
 
476 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000332242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0704  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.79 
 
 
328 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01899  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  34.34 
 
 
434 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  33.82 
 
 
431 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.69 
 
 
472 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.6 
 
 
325 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1237  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
429 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
427 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  39.47 
 
 
431 aa  122  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.05 
 
 
451 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  33.82 
 
 
431 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.12 
 
 
446 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.623923 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0934  cell-cycle protein  34.62 
 
 
427 aa  121  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.504247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.44 
 
 
335 aa  121  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.379803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1084  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.55 
 
 
460 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.55 
 
 
460 aa  121  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  31.22 
 
 
354 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1125  PP-loop  33.62 
 
 
484 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00891393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.8 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.75 
 
 
445 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0726  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.5 
 
 
426 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.238503  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0148  MesJ/Ycf62 family protein  30.23 
 
 
432 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 
682 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>