42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2749 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  64.44 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  55.29 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  55.17 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  50.57 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  50.57 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  47.06 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  48.81 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  51.22 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  56.25 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  58.93 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  43.68 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  43.75 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  40.7 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  36.25 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  38.03 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  33.73 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  39.76 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  36.49 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  36.49 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  36.49 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  36.49 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  36.25 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  37.84 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  32.43 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  31.51 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  33.78 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  35.44 
 
 		 93 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  34.67 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  41.89 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  35.82 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>