More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2702 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  66.34 
 
 
309 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  68.59 
 
 
198 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  64.92 
 
 
201 aa  257  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  62.83 
 
 
196 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  65.45 
 
 
201 aa  241  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  50.48 
 
 
201 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  54.64 
 
 
219 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  53.55 
 
 
191 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  54.55 
 
 
197 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  54.1 
 
 
199 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  50.56 
 
 
201 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  54.1 
 
 
191 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  54.1 
 
 
191 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
187 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  52.63 
 
 
198 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  51.89 
 
 
186 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  56.59 
 
 
209 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  51.91 
 
 
182 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  53.01 
 
 
194 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  52.2 
 
 
193 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  52.2 
 
 
193 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  48.09 
 
 
181 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  47.5 
 
 
193 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  50.27 
 
 
188 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  53.09 
 
 
204 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  53.09 
 
 
204 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  53.51 
 
 
197 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.63 
 
 
201 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  49.75 
 
 
203 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  52.75 
 
 
184 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  57.72 
 
 
188 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  51.65 
 
 
184 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  56.22 
 
 
189 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  45.9 
 
 
183 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  60.43 
 
 
197 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  45.9 
 
 
183 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  55.62 
 
 
209 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  51.4 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  48.65 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 
184 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  61.27 
 
 
176 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  54.05 
 
 
190 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  54.1 
 
 
190 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  48.95 
 
 
190 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  48.95 
 
 
190 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  48.95 
 
 
190 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  54.55 
 
 
196 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  48.42 
 
 
224 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  47.85 
 
 
185 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.5 
 
 
188 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  48.13 
 
 
184 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 
184 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 
197 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 
197 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  52.06 
 
 
215 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  45.18 
 
 
194 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 
185 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  48.39 
 
 
185 aa  158  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  55.08 
 
 
208 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  47.8 
 
 
188 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  48.68 
 
 
189 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  47.8 
 
 
187 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  47.8 
 
 
190 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  46.77 
 
 
188 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  48.02 
 
 
188 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  50.99 
 
 
189 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  45.9 
 
 
185 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  44.92 
 
 
183 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  48.63 
 
 
228 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  47.03 
 
 
205 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  46.67 
 
 
210 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 
188 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  44.81 
 
 
185 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  46.74 
 
 
193 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  46.74 
 
 
193 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  46.45 
 
 
185 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  46.45 
 
 
185 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 
201 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  46.74 
 
 
193 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  48.9 
 
 
184 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 
193 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  43.06 
 
 
204 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  45.65 
 
 
193 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  46.91 
 
 
204 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  46.91 
 
 
204 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  46.91 
 
 
204 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44.44 
 
 
203 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 
199 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  47.89 
 
 
206 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 
189 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 
188 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  48.33 
 
 
214 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  52.17 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  53.62 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  52.17 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.81 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 
189 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 
189 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>