More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1970 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1970  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  47.53 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  47.09 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 223 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10550  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.5 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.86 
 
 		 226 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.86 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  44.59 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.73 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  44.34 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.96 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3932  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.01 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  45.78 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03101  two-component response regulator transcription regulator protein  46.82 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  45.37 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6011  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2066  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2085  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>