More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0660 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0809  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  100 
 
 		 412 aa  820    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0660  malic enzyme family protein  100 
 
 		 412 aa  820    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  62.21 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  60.2 
 
 		 412 aa  464  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  62.07 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0244  malate dehydrogenase  58.25 
 
 		 401 aa  448  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  55.91 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4187  malate dehydrogenase  57.18 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  56.05 
 
 		 752 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  57.28 
 
 		 422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  56.3 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  57.04 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  57.53 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  57.28 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00051  malate oxidoreductase  55.23 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  57.28 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  55.45 
 
 		 757 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  56.3 
 
 		 422 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  54.95 
 
 		 761 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  55.8 
 
 		 752 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  55.56 
 
 		 760 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2051  NADP-dependent malic enzyme, truncated  55.56 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0554  malate dehydrogenase  56.54 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  53.49 
 
 		 762 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  55.8 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002303  NADP-dependent malic enzyme  54.63 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.751894  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  56.19 
 
 		 764 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.64 
 
 		 764 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  56.82 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3757  malate dehydrogenase  53.94 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  57.04 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  56.16 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  57.04 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  55.42 
 
 		 753 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3014  malic enzyme  56.48 
 
 		 751 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  56.4 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3353  malate dehydrogenase  54.43 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  56.86 
 
 		 761 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  54.36 
 
 		 749 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4881  NADP-dependent malic enzyme, truncated  54.57 
 
 		 415 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0687  hypothetical protein  57.28 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  55.69 
 
 		 761 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  56.68 
 
 		 763 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  54.36 
 
 		 754 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  54.81 
 
 		 752 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  54.07 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  52.91 
 
 		 754 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  54.36 
 
 		 749 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2745  NADP-dependent malic enzyme  55.06 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0538  malate dehydrogenase  56.05 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  56.93 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  52.48 
 
 		 771 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_002978  WD0488  NADP-dependent malic enzyme  54.88 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0331  NADP-dependent malic enzyme, truncated  54.07 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4118  malate oxidoreductase, putative  55.8 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0705  hypothetical protein  57.28 
 
 		 411 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  53.94 
 
 		 763 aa  425  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  56.44 
 
 		 763 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  56.1 
 
 		 478 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  53.94 
 
 		 758 aa  427  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  53.98 
 
 		 780 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  55.2 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  55.2 
 
 		 761 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3492  malate dehydrogenase  55.8 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0460  malate dehydrogenase  55.56 
 
 		 414 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  55.31 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0383  malate dehydrogenase  56.05 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0499  malate dehydrogenase  56.4 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3841  malate dehydrogenase  56.4 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  53.47 
 
 		 759 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  53.48 
 
 		 779 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0478  malate dehydrogenase  56.4 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  55.45 
 
 		 761 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3669  malic enzyme, NAD-binding  55.56 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0448  malate dehydrogenase  55.56 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  55.86 
 
 		 758 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  54.15 
 
 		 771 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  52.96 
 
 		 769 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2254  putative malate dehydrogenase  55.64 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.966162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  54.21 
 
 		 771 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0502  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  56.4 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  53.83 
 
 		 773 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  54.46 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  56.44 
 
 		 753 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  56.05 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  54.09 
 
 		 755 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  54.33 
 
 		 758 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3774  malate dehydrogenase  56.05 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  53.73 
 
 		 751 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  55.86 
 
 		 758 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  56.05 
 
 		 754 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  54.07 
 
 		 757 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  53.09 
 
 		 764 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  55.2 
 
 		 752 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  55.69 
 
 		 754 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  53.09 
 
 		 764 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  55.47 
 
 		 752 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  54.43 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  52.57 
 
 		 759 aa  412  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  54.95 
 
 		 763 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>