More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3014 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  45.91 
 
 		 759 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  45.78 
 
 		 759 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  54.16 
 
 		 752 aa  789    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  52.65 
 
 		 749 aa  770    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  52.32 
 
 		 771 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  45.78 
 
 		 759 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  50.99 
 
 		 761 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  53.4 
 
 		 758 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  46.69 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  45.38 
 
 		 759 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  47.73 
 
 		 763 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  51.53 
 
 		 757 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  71.64 
 
 		 751 aa  1088    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  53.84 
 
 		 752 aa  795    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  48.13 
 
 		 754 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  46.69 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  46.69 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  45.78 
 
 		 759 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  46.68 
 
 		 763 aa  670    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  45.78 
 
 		 759 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  45.66 
 
 		 763 aa  637    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  46.69 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  52.92 
 
 		 749 aa  770    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  46.69 
 
 		 773 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  45.78 
 
 		 759 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  52.06 
 
 		 771 aa  758    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  52.21 
 
 		 783 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  53.68 
 
 		 749 aa  796    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  72.04 
 
 		 751 aa  1063    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  47.35 
 
 		 763 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  53.04 
 
 		 752 aa  801    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  45.38 
 
 		 759 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  46.69 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  45.38 
 
 		 759 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  48.2 
 
 		 753 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  52.59 
 
 		 771 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  46.83 
 
 		 759 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  47.28 
 
 		 754 aa  697    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1754  malic enzyme  74.87 
 
 		 750 aa  1081    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.707566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  53.84 
 
 		 764 aa  741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  45.91 
 
 		 759 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  47.94 
 
 		 766 aa  698    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  45.51 
 
 		 759 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  52.46 
 
 		 771 aa  713    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  46.44 
 
 		 759 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  52.19 
 
 		 749 aa  764    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  45.78 
 
 		 759 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2118  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  71.87 
 
 		 750 aa  1037    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  48.66 
 
 		 754 aa  638    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3014  malic enzyme  100 
 
 		 751 aa  1484    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  53.2 
 
 		 780 aa  790    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  52.45 
 
 		 779 aa  783    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  51.59 
 
 		 757 aa  739    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  53.55 
 
 		 749 aa  793    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  45.51 
 
 		 759 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  46.69 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  55.04 
 
 		 752 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  50.73 
 
 		 755 aa  721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  45.38 
 
 		 759 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  71.43 
 
 		 750 aa  1043    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  53.25 
 
 		 773 aa  736    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  54.13 
 
 		 757 aa  758    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  46.69 
 
 		 756 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  53.26 
 
 		 758 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  45.78 
 
 		 759 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  45.91 
 
 		 759 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  45.51 
 
 		 759 aa  635  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  45.06 
 
 		 759 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  47.35 
 
 		 764 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  46.02 
 
 		 759 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  46.02 
 
 		 764 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  46.43 
 
 		 756 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  46.37 
 
 		 756 aa  631  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  46.37 
 
 		 756 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  46.37 
 
 		 756 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  45.63 
 
 		 760 aa  628  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  45.89 
 
 		 759 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  46.24 
 
 		 756 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  47.04 
 
 		 758 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  46.24 
 
 		 756 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  45.89 
 
 		 759 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  45.9 
 
 		 759 aa  625  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  45.9 
 
 		 761 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  45.78 
 
 		 777 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  46.11 
 
 		 756 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  44.5 
 
 		 758 aa  623  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  45.5 
 
 		 760 aa  625  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  45.76 
 
 		 764 aa  622  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  45.57 
 
 		 773 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  46.11 
 
 		 756 aa  625  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1729  malic enzyme  46.45 
 
 		 763 aa  625  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  44.72 
 
 		 776 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  45.77 
 
 		 761 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  44.75 
 
 		 779 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  44.58 
 
 		 764 aa  615  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  44.71 
 
 		 764 aa  616  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  45.31 
 
 		 775 aa  618  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  45.04 
 
 		 760 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5338  malic enzyme  47.77 
 
 		 761 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  45.25 
 
 		 752 aa  612  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>