More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1729 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  59.63 
 
 		 759 aa  922    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.76 
 
 		 759 aa  924    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  47.6 
 
 		 752 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  63.89 
 
 		 756 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  60.42 
 
 		 774 aa  892    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  55.97 
 
 		 768 aa  809    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  63.37 
 
 		 773 aa  950    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  64.11 
 
 		 781 aa  948    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  56.97 
 
 		 759 aa  820    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  46.79 
 
 		 749 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  45.41 
 
 		 763 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  62.01 
 
 		 773 aa  937    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  60.29 
 
 		 774 aa  893    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  63.89 
 
 		 756 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  64.32 
 
 		 769 aa  944    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  63.89 
 
 		 756 aa  968    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  62.2 
 
 		 776 aa  901    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  64.32 
 
 		 769 aa  944    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  60.88 
 
 		 770 aa  895    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  57.6 
 
 		 759 aa  846    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  59.35 
 
 		 765 aa  865    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  64.32 
 
 		 769 aa  944    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  63.89 
 
 		 756 aa  968    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  59.89 
 
 		 759 aa  928    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  47.16 
 
 		 764 aa  651    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  64.32 
 
 		 769 aa  946    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  55.84 
 
 		 779 aa  869    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  65.44 
 
 		 759 aa  977    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  63.75 
 
 		 758 aa  976    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  63.19 
 
 		 777 aa  961    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  63.31 
 
 		 774 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  45.91 
 
 		 763 aa  641    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  63.89 
 
 		 756 aa  968    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  59.65 
 
 		 760 aa  855    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  63.89 
 
 		 773 aa  971    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  64.32 
 
 		 769 aa  946    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  63.4 
 
 		 770 aa  933    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  60.66 
 
 		 759 aa  920    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  824    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  44.3 
 
 		 759 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  56.97 
 
 		 759 aa  820    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  63.25 
 
 		 756 aa  958    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  64.72 
 
 		 785 aa  958    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  61.16 
 
 		 782 aa  900    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  47.87 
 
 		 752 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  64.32 
 
 		 769 aa  944    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  56.29 
 
 		 757 aa  823    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  59.18 
 
 		 766 aa  860    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  56.3 
 
 		 769 aa  837    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  47.94 
 
 		 753 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  64.46 
 
 		 768 aa  947    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  64.15 
 
 		 756 aa  978    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  61.84 
 
 		 770 aa  879    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  60.24 
 
 		 769 aa  836    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  56.56 
 
 		 779 aa  891    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  60.26 
 
 		 769 aa  919    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  45.64 
 
 		 758 aa  637    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  48.46 
 
 		 754 aa  681    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  56.02 
 
 		 758 aa  791    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  62.38 
 
 		 769 aa  949    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  59.02 
 
 		 771 aa  876    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  59.31 
 
 		 769 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  59.6 
 
 		 767 aa  878    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  62.33 
 
 		 772 aa  910    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  63.8 
 
 		 760 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  62.73 
 
 		 779 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  62.43 
 
 		 772 aa  944    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  63.89 
 
 		 756 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  60.77 
 
 		 769 aa  850    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  62.07 
 
 		 774 aa  896    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  59.25 
 
 		 765 aa  857    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  55.57 
 
 		 777 aa  865    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  63.32 
 
 		 773 aa  972    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  63.44 
 
 		 774 aa  907    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  55.39 
 
 		 759 aa  803    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  45.14 
 
 		 766 aa  643    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  48.39 
 
 		 754 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  64.85 
 
 		 785 aa  960    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  63.65 
 
 		 756 aa  961    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  61.6 
 
 		 764 aa  941    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  61.89 
 
 		 770 aa  897    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  47.73 
 
 		 761 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  48.07 
 
 		 757 aa  672    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  56.18 
 
 		 755 aa  833    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  64.32 
 
 		 771 aa  946    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  44.3 
 
 		 751 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  63.83 
 
 		 776 aa  983    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  47.33 
 
 		 752 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  47.54 
 
 		 758 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  55.79 
 
 		 755 aa  763    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  63.86 
 
 		 756 aa  958    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  64.72 
 
 		 766 aa  958    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  61.96 
 
 		 766 aa  902    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  63.02 
 
 		 764 aa  915    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  63.65 
 
 		 756 aa  961    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  64.85 
 
 		 785 aa  960    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  61.16 
 
 		 766 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  48.61 
 
 		 757 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  63.89 
 
 		 756 aa  968    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  58.97 
 
 		 777 aa  881    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>