More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15291 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_15151  tyrosyl-tRNA synthetase  96.36 
 
 		 412 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14901  tyrosyl-tRNA synthetase  82.04 
 
 		 412 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1427  tyrosyl-tRNA synthetase  94.17 
 
 		 412 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15291  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 412 aa  833    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  61.94 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05611  tyrosyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 408 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2102  tyrosyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13831  tyrosyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0567  tyrosyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0857  tyrosyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.16761  hitchhiker  0.00258196 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2570  tyrosyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2067  tyrosyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 418 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 413 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 401 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 392 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 454 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 413 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 421 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 401 aa  300  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 413 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 416 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 399 aa  295  7e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 412 aa  296  7e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 401 aa  295  8e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 400 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  41.12 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 400 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 398 aa  292  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02940  tyrosyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 403 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 400 aa  289  7e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 403 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3445  tyrosyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109315 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 397 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0300  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139945  normal  0.0172609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 397 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>