262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0812 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0812  di/tripeptide transporter homolog IraB  100 
 
 
502 aa  996    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0783  di/tripeptide transporter homolog IraB  99.2 
 
 
502 aa  991    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  33.06 
 
 
504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  32.08 
 
 
528 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  28.86 
 
 
500 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  28.86 
 
 
500 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  29.94 
 
 
502 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  29.98 
 
 
500 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  29.98 
 
 
500 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  29.98 
 
 
500 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  29.98 
 
 
500 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  29.98 
 
 
500 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  29.98 
 
 
500 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  29.98 
 
 
500 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  29.98 
 
 
500 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  29.42 
 
 
500 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  30.06 
 
 
501 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  30.06 
 
 
501 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  29.86 
 
 
501 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  29.86 
 
 
501 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  30.06 
 
 
501 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  30.55 
 
 
506 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  31.2 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  29.7 
 
 
506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  29.22 
 
 
514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  28.36 
 
 
489 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  28.36 
 
 
489 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  28.36 
 
 
489 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  28.36 
 
 
489 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  28.36 
 
 
489 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  28.36 
 
 
489 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  28.36 
 
 
489 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  28.57 
 
 
489 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  28.01 
 
 
490 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  28.01 
 
 
490 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  28.01 
 
 
490 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  29.92 
 
 
511 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  28.01 
 
 
490 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  27.94 
 
 
489 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  30.02 
 
 
488 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  30.02 
 
 
501 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  28.72 
 
 
490 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  28.18 
 
 
495 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  28.98 
 
 
516 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  28.98 
 
 
516 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  29.33 
 
 
516 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 
546 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  29.18 
 
 
516 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  28.89 
 
 
517 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  28.66 
 
 
517 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  28.66 
 
 
521 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  29.27 
 
 
523 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  28.28 
 
 
500 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  28.28 
 
 
500 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  28.06 
 
 
551 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  27.07 
 
 
506 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  27.54 
 
 
507 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  28.06 
 
 
506 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  27.86 
 
 
513 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  28.28 
 
 
551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  28.07 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  27.84 
 
 
506 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  27.84 
 
 
507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  28.07 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  28.07 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  28.07 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  27.35 
 
 
506 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  27.56 
 
 
506 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  27.43 
 
 
506 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  27.43 
 
 
506 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  27.82 
 
 
513 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  28.99 
 
 
501 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  28.05 
 
 
496 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  27.42 
 
 
499 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  26.33 
 
 
507 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  28.09 
 
 
504 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  25.97 
 
 
510 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  26.65 
 
 
501 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  25.8 
 
 
517 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  28.85 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  28.85 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  25.93 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  24.95 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  24.95 
 
 
528 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  28.54 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  27.66 
 
 
463 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  28.63 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  26.52 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  26.52 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  25.1 
 
 
516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  27.02 
 
 
461 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  25.64 
 
 
517 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  27.02 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  24.33 
 
 
499 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  26.81 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  25.15 
 
 
534 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  24.95 
 
 
544 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  24.55 
 
 
527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  27.96 
 
 
497 aa  127  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  26.3 
 
 
463 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>