More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0638 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  97.66 
 
 
428 aa  867    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  890    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  37.56 
 
 
437 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  39.66 
 
 
426 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  39.41 
 
 
426 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  38.41 
 
 
446 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  38.08 
 
 
475 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  39.51 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  37.44 
 
 
441 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  37.38 
 
 
445 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  35.56 
 
 
437 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  37.69 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  36.12 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  37.5 
 
 
439 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  37.34 
 
 
437 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  36.08 
 
 
438 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  35.51 
 
 
439 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  36.87 
 
 
442 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  33.72 
 
 
444 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  36.5 
 
 
454 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  36.08 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  35.59 
 
 
451 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  34.55 
 
 
454 aa  239  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  35.78 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  34.78 
 
 
454 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  33.25 
 
 
453 aa  232  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  34.89 
 
 
425 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  33.18 
 
 
436 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  32.85 
 
 
439 aa  228  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.9 
 
 
439 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  33.85 
 
 
441 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  34.53 
 
 
428 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  33.42 
 
 
447 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  33.81 
 
 
448 aa  222  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  35.4 
 
 
434 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  33.66 
 
 
445 aa  220  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  32.69 
 
 
426 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.89 
 
 
442 aa  217  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  33.6 
 
 
446 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  32.32 
 
 
446 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  36.58 
 
 
439 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  31.57 
 
 
467 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  32.41 
 
 
441 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.97 
 
 
434 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  30.05 
 
 
418 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  34.56 
 
 
399 aa  203  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 
455 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 
455 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  32.55 
 
 
419 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  32.45 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.25 
 
 
448 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.87 
 
 
423 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.87 
 
 
423 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.75 
 
 
448 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 
434 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.95 
 
 
423 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  30.63 
 
 
440 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.87 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.87 
 
 
423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  33.5 
 
 
430 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  32.1 
 
 
420 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.12 
 
 
423 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  28.9 
 
 
439 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  32.08 
 
 
440 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 
459 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 
441 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 
422 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  30.2 
 
 
447 aa  186  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  30.89 
 
 
430 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  30.38 
 
 
439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  31.98 
 
 
422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  28.51 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.55 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.08 
 
 
441 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  31.88 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  31.14 
 
 
437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  28.67 
 
 
420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.82 
 
 
441 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  33.08 
 
 
430 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  30.95 
 
 
440 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  32.11 
 
 
440 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  32.97 
 
 
423 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  32.25 
 
 
423 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.97 
 
 
423 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.97 
 
 
423 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  32.97 
 
 
423 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.97 
 
 
423 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.97 
 
 
423 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.59 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  29.57 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  29.57 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  29.86 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  30.51 
 
 
440 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.07 
 
 
423 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  30.88 
 
 
425 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  30.16 
 
 
425 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  31.02 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  32.27 
 
 
420 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  31.19 
 
 
444 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>