More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0334 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  88.37 
 
 
258 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  29.96 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  29.96 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2134  hypothetical protein  29.51 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2109  hypothetical protein  28.69 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  42.54 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  37.21 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  35.16 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  34.35 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  39.62 
 
 
269 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.26 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.09 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.39 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.03 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.47 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.43 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 
415 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.17 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  32.58 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.88 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.31 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.65 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.7 
 
 
233 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.81 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  24.6 
 
 
253 aa  59.3  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
283 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.32 
 
 
251 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.52 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.43 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  30.43 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.52 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  27.75 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.01 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.99 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.06 
 
 
309 aa  55.8  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25.35 
 
 
266 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  29.25 
 
 
258 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
280 aa  55.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.17 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  36.61 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  30.08 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  26.61 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.17 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  26.16 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  24.6 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.46 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.79 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  27.64 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  26.54 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  34.83 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  25.67 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.91 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 
1005 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  26.54 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
201 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>