More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2074 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  234  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  99.12 
 
 		 114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  76.47 
 
 		 116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  74.49 
 
 		 107 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  72.82 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  70.87 
 
 		 114 aa  149  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  69.07 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  61.17 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  55.91 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  52.17 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  50.53 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  48.94 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  42.86 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  42 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  45.05 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  50 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  40.4 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  55.56 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  35.71 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.83 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.83 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  44.09 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.01 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  34.74 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>