More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0084 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 343 aa  681    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  98.83 
 
 		 343 aa  674    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5043  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.95 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0597  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.09 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0489  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.85 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0500  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.85 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0511  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.85 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2846  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.63 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.25 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2419  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.06 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.57961  normal  0.818937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.99 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4236  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.54 
 
 		 344 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  43.41 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4389  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.67 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  44.71 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.24 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1221  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.17 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.665213  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.44 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.44 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.81 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.62 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2068  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.89 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.04 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  32.94 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  33.05 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  32.94 
 
 		 364 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  33.14 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  32.85 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  32.85 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  33.14 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  39.08 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.83 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  31.32 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.91 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.22 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.08 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.41 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.44 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.08 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  30.38 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  36.02 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.87 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.99 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.28 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.56 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  36.02 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  30.09 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.37 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.7 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.52 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.26 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.2 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  32.92 
 
 		 359 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.58 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.2 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.83 
 
 		 362 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  30.09 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.25 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.55 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.03 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.8 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.09 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.81 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  30.59 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.57 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.52 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.13 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.29 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.29 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.99 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.27 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.71 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  38.77 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.29 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.2 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.42 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.09 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  37.89 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.63 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  37.89 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.9 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.9 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  33.13 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.3 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.43 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.04 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.65 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.65 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.65 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  37.23 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  37.62 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.82 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  37.62 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.85 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.99 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  32.75 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02145  2-nitropropane dioxygenase  35.47 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.62 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>