176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3199 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  326  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  41.98 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  50 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  40.16 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  47.66 
 
 		 114 aa  99  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  47.66 
 
 		 114 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 128 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  48.89 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  46.23 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  46.85 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  52.27 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 116 aa  84  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  52.83 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  45 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.51 
 
 		 272 aa  80.9  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  40.87 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  40.87 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  43 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  41 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  33.05 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  39.08 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.89 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  33.93 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  39.13 
 
 		 262 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 262 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  48.35 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  29.09 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  42.22 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  34.23 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  41.11 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  35.29 
 
 		 370 aa  57.4  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  42.68 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  42.53 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  31.65 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  36.46 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  41.38 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  33.66 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  31.25 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  41.76 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  46 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 267 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.78 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  25.23 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  45.28 
 
 		 269 aa  51.2  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  42.86 
 
 		 265 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  50.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 236 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40.23 
 
 		 265 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  40.23 
 
 		 265 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  29 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  48.94 
 
 		 269 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  27.1 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 263 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 269 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  29 
 
 		 233 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  29 
 
 		 245 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.51 
 
 		 366 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  48.94 
 
 		 270 aa  47.8  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  29.11 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  51.06 
 
 		 270 aa  47.8  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  47.8  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.67 
 
 		 254 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 254 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  39.76 
 
 		 269 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  32.29 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  33.98 
 
 		 366 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>