38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4433 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  100 
 
 
1099 aa  2116    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  45.89 
 
 
4428 aa  344  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  40.59 
 
 
2796 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  39.23 
 
 
3340 aa  269  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  39.07 
 
 
1641 aa  192  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  46.67 
 
 
764 aa  169  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  47.14 
 
 
756 aa  170  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  57.62 
 
 
873 aa  169  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  56.95 
 
 
7434 aa  169  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  46.19 
 
 
790 aa  169  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  49.48 
 
 
1196 aa  168  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  48.96 
 
 
768 aa  167  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  55.63 
 
 
3864 aa  166  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  54.67 
 
 
768 aa  164  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  56.29 
 
 
819 aa  164  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  48.44 
 
 
860 aa  164  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  55.26 
 
 
4830 aa  163  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  56.29 
 
 
954 aa  162  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  47.92 
 
 
777 aa  162  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  53.64 
 
 
763 aa  160  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  55.26 
 
 
781 aa  159  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  54.67 
 
 
770 aa  158  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  53.33 
 
 
889 aa  155  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  47.67 
 
 
465 aa  153  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  53.47 
 
 
145 aa  145  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  50 
 
 
479 aa  142  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  32.76 
 
 
846 aa  83.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  44.78 
 
 
491 aa  76.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  31.63 
 
 
462 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  32.4 
 
 
918 aa  63.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  33.13 
 
 
437 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  45.74 
 
 
533 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  33.01 
 
 
486 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  37.04 
 
 
3295 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  48.1 
 
 
961 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  44.66 
 
 
1526 aa  47.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  34.82 
 
 
551 aa  46.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  31.21 
 
 
647 aa  45.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>