More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2134 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  86.08 
 
 		 168 aa  285  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  73.86 
 
 		 164 aa  239  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  74.03 
 
 		 173 aa  236  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  45.93 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.18 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  42.11 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.9 
 
 		 187 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  35.11 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 148 aa  97.1  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  40.15 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 145 aa  94  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  34.51 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 149 aa  90.9  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 158 aa  90.9  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  39.39 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  36.5 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.77 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  38.03 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  38.03 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.81 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 145 aa  84  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  40.31 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  35.37 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.17 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>