45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1526 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  60.53 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  53.29 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  40.69 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  41.13 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  39.72 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  38.62 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  38.89 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  38.89 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  38.89 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  39.55 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  42.65 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  41.22 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  41.91 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  41.91 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  34.21 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  30.07 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  34.07 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  38.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  27.21 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  27.21 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.5 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  34.72 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  33.91 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  39.62 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  42.37 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  32.76 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  40 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  33.87 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  32.67 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  36 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  38 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  36 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  34.21 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  36 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  36 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  36 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  42.55 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  34.69 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  33.33 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  47.92 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  39.47 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>