140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1135 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  81.28 
 
 
219 aa  333  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  78.74 
 
 
216 aa  324  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  71 
 
 
213 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  65.83 
 
 
217 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  66.85 
 
 
219 aa  248  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  65.73 
 
 
219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  67.19 
 
 
210 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  67.53 
 
 
206 aa  240  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0397  ferric reductase domain-containing protein  61.36 
 
 
241 aa  207  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0907023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.74 
 
 
237 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  52.82 
 
 
224 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.14 
 
 
217 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.19 
 
 
225 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.75 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  53.93 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.21 
 
 
229 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.21 
 
 
233 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  52.6 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.74 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  53.89 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.74 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  51.91 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.74 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.74 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.38 
 
 
237 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.38 
 
 
237 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.38 
 
 
237 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.38 
 
 
237 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.38 
 
 
241 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.38 
 
 
241 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.38 
 
 
241 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.1 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  46.19 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  50 
 
 
192 aa  177  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  47.77 
 
 
227 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  48.19 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.96 
 
 
213 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.71 
 
 
229 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  45.96 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  39.8 
 
 
642 aa  144  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.58 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.25 
 
 
201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  40.44 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.67 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.93 
 
 
262 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  42.2 
 
 
262 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.05 
 
 
220 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.05 
 
 
220 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  39.29 
 
 
214 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.15 
 
 
220 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.26 
 
 
209 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.92 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  46.5 
 
 
183 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.94 
 
 
204 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.84 
 
 
209 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  36.06 
 
 
224 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  42.44 
 
 
207 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.45 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.48 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1258  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.76 
 
 
293 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.36 
 
 
585 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.97 
 
 
197 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.89 
 
 
217 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.91 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  36.7 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.48 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1866  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.18 
 
 
215 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.139445  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0172  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.24 
 
 
294 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1411  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.72 
 
 
201 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2484  ferric reductase domain-containing protein  41.71 
 
 
204 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757906  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0078  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.72 
 
 
201 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.883139  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.5 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.54 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.68 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2233  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.17 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00590459  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2056  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.96 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000305808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.43 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.86 
 
 
208 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.13 
 
 
222 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2103  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.96 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.8 
 
 
222 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.8 
 
 
222 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.2 
 
 
215 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  35.33 
 
 
215 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.03 
 
 
217 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0986  hypothetical protein  38.14 
 
 
210 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2122  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.74 
 
 
205 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2856  ferric reductase domain-containing protein  35.16 
 
 
199 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.375369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1636  ferric reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
295 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4539  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.43 
 
 
203 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000898967  hitchhiker  0.00229075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.77 
 
 
199 aa  101  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3979  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.1 
 
 
200 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2344  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.33 
 
 
203 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3732  ferric reductase domain-containing protein  37.89 
 
 
317 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2526  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.84 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0851  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.8 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000563409  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3993  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
184 aa  95.5  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.91 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>