138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2526 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2526  putative sulfite oxidase subunit YedZ  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2344  putative sulfite oxidase subunit YedZ  71.79 
 
 
203 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  66.14 
 
 
213 aa  254  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  64.8 
 
 
209 aa  241  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  65.57 
 
 
207 aa  241  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.73 
 
 
209 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  66.67 
 
 
222 aa  235  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  66.16 
 
 
222 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  66.16 
 
 
222 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2056  putative sulfite oxidase subunit YedZ  66.16 
 
 
222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000305808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2103  putative sulfite oxidase subunit YedZ  65.66 
 
 
222 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  65.61 
 
 
215 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2122  putative sulfite oxidase subunit YedZ  70.29 
 
 
205 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  63.49 
 
 
215 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1866  putative sulfite oxidase subunit YedZ  63.49 
 
 
215 aa  224  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.139445  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2233  putative sulfite oxidase subunit YedZ  62.96 
 
 
215 aa  222  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00590459  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.44 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  52.46 
 
 
209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  48.24 
 
 
215 aa  191  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  49.49 
 
 
206 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.93 
 
 
211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  46.37 
 
 
211 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.37 
 
 
211 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  45.5 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  45.5 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.37 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.37 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.37 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.37 
 
 
211 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3993  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 
184 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3570  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.21 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.230846  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3691  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.21 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.204228  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3569  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.21 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000371311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.71 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.155081  normal  0.0228155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3676  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.21 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.60664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3641  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.21 
 
 
199 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.198888  hitchhiker  0.00058826 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3839  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.59 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0125482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4415  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.2 
 
 
199 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0107399  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.9 
 
 
232 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.7 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.7 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.29 
 
 
233 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.38 
 
 
244 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.64 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.64 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.11 
 
 
228 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.11 
 
 
228 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0246  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.7 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0256  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.21 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  40.11 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0394  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.45 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1202  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.45 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.701545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0461  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.45 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.65 
 
 
222 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.99 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
642 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.56 
 
 
237 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  39.11 
 
 
206 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.35 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.35 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.92 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  33.16 
 
 
215 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.43 
 
 
203 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  35.84 
 
 
222 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
219 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.16 
 
 
225 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  37.65 
 
 
210 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.66 
 
 
220 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3681  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.29 
 
 
199 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0572455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.07 
 
 
218 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  38.24 
 
 
219 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.16 
 
 
218 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.2 
 
 
197 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  35.88 
 
 
207 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.11 
 
 
217 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
192 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  34.83 
 
 
214 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  37.57 
 
 
217 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.14 
 
 
213 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.57 
 
 
236 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  29.32 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
241 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
237 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
237 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
237 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
237 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
241 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
241 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  34.5 
 
 
214 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  31.96 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.59 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  36.27 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0172  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.42 
 
 
294 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.95 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.16 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.95 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.88 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.03 
 
 
218 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4539  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.75 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000898967  hitchhiker  0.00229075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>