140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2484 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2484  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  400  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757906  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  50.87 
 
 
213 aa  164  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  50 
 
 
229 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.08 
 
 
217 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.16 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  45.9 
 
 
216 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  51.95 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.83 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.45 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.34 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  49.72 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  43.17 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.03 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  50 
 
 
224 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  47.13 
 
 
204 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.2 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.2 
 
 
228 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.2 
 
 
228 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.65 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  41.94 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.65 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  46.39 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.78 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  46.06 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.71 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.65 
 
 
229 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  49.21 
 
 
217 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.24 
 
 
208 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.17 
 
 
244 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.48 
 
 
222 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  46.43 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.65 
 
 
237 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.65 
 
 
237 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.65 
 
 
237 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.65 
 
 
237 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.65 
 
 
241 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.65 
 
 
241 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.65 
 
 
241 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  43.24 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  48.41 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  45.57 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.82 
 
 
236 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  46.58 
 
 
262 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  41.76 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.45 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.64 
 
 
585 aa  118  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  46.5 
 
 
262 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0172  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.46 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  38.92 
 
 
224 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  36.96 
 
 
642 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.05 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0397  ferric reductase domain-containing protein  43.03 
 
 
241 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0907023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2856  ferric reductase domain-containing protein  40.22 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.375369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  39.88 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.45 
 
 
220 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.91 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.24 
 
 
218 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  38.59 
 
 
207 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3979  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.57 
 
 
200 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.76 
 
 
217 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.79 
 
 
220 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.29 
 
 
201 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.79 
 
 
220 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1636  ferric reductase domain-containing protein  38.92 
 
 
295 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.06 
 
 
209 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.76 
 
 
209 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1258  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.23 
 
 
293 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.85 
 
 
202 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  37.84 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.05 
 
 
199 aa  97.8  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2925  ferric reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
285 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.365011  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.71 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  38.71 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.71 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  38.71 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  37.14 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.71 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.71 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.71 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.71 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.71 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  29.61 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3993  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.57 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3732  ferric reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
317 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2050  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  44.65 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106334  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  31.61 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.08 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.54 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0064  ferric reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.39119  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  32.02 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2344  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.75 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.54 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1866  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.54 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.139445  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.3 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.19 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.19 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  35.36 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2122  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.48 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3512  ferric reductase domain-containing protein  33.89 
 
 
288 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0143111  normal  0.239118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>