140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3258 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  100 
 
 
218 aa  433  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  97.25 
 
 
218 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  84.79 
 
 
217 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  75.92 
 
 
225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  71.92 
 
 
224 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  57.29 
 
 
228 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  57.29 
 
 
228 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.55 
 
 
233 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.78 
 
 
228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  61.54 
 
 
232 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  61.75 
 
 
244 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.28 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.78 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  61.54 
 
 
237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.28 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.05 
 
 
236 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.39 
 
 
241 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.39 
 
 
241 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.39 
 
 
237 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.39 
 
 
237 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.39 
 
 
237 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.39 
 
 
237 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.39 
 
 
241 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  54.84 
 
 
192 aa  201  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  52.46 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  50.77 
 
 
219 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  48.95 
 
 
216 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  49.75 
 
 
204 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  53.26 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  49.73 
 
 
213 aa  181  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  50 
 
 
219 aa  175  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  50 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.15 
 
 
229 aa  168  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  51.03 
 
 
227 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  50 
 
 
221 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  50.29 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.18 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  52.87 
 
 
214 aa  158  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  51.37 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  44.04 
 
 
213 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  45.41 
 
 
215 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0397  ferric reductase domain-containing protein  46.71 
 
 
241 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0907023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  44.74 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  51.28 
 
 
183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.88 
 
 
218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.66 
 
 
585 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.45 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  35.86 
 
 
642 aa  131  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.91 
 
 
220 aa  131  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  45 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.58 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.34 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.34 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.39 
 
 
201 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  44.1 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  40.84 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.57 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.34 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.5 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0878  putative sulfite oxidase subunit YedZ  53.52 
 
 
221 aa  118  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  37.99 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.68 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  42.05 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2484  ferric reductase domain-containing protein  47.53 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757906  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  38.42 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.07 
 
 
209 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4415  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.55 
 
 
199 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0107399  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.66 
 
 
217 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.33 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.97 
 
 
213 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3979  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.04 
 
 
200 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  37.95 
 
 
211 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.95 
 
 
211 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  37.95 
 
 
211 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.82 
 
 
215 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.35 
 
 
211 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.95 
 
 
211 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.95 
 
 
211 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.95 
 
 
211 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.95 
 
 
211 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.95 
 
 
211 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1866  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.82 
 
 
215 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.139445  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.52 
 
 
215 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2856  ferric reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
199 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.375369  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2233  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.33 
 
 
215 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00590459  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3839  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.51 
 
 
199 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0125482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.92 
 
 
204 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1411  putative sulfite oxidase subunit YedZ  44.19 
 
 
201 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0078  putative sulfite oxidase subunit YedZ  44.19 
 
 
201 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.883139  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.92 
 
 
197 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.49 
 
 
222 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.49 
 
 
222 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3512  ferric reductase domain-containing protein  36.26 
 
 
288 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0143111  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.52 
 
 
203 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1636  ferric reductase domain-containing protein  39.75 
 
 
295 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3691  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.73 
 
 
199 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.204228  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0172  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  36.25 
 
 
294 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2925  ferric reductase domain-containing protein  34.13 
 
 
285 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.365011  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1258  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.84 
 
 
293 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>