137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4675 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  100 
 
 
197 aa  383  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  94.92 
 
 
203 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4539  putative sulfite oxidase subunit YedZ  97.46 
 
 
203 aa  353  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000898967  hitchhiker  0.00229075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  88.72 
 
 
204 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0986  hypothetical protein  70.41 
 
 
210 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0851  putative sulfite oxidase subunit YedZ  69.9 
 
 
210 aa  263  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000563409  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4783  putative sulfite oxidase subunit YedZ  70.26 
 
 
207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214193  hitchhiker  0.0081736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62100  putative sulfite oxidase subunit YedZ  66.14 
 
 
202 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813375  hitchhiker  0.00458105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5405  putative sulfite oxidase subunit YedZ  66.14 
 
 
202 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000422171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.69 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00213406  hitchhiker  0.0000892123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07340  putative sulfite oxidase subunit YedZ  64.12 
 
 
200 aa  197  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.533948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  50 
 
 
206 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  40.11 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.2 
 
 
220 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.97 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  41.05 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  45.77 
 
 
214 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
219 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.26 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.83 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  40 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  38.29 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.46 
 
 
207 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  39.39 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.2 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.36 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  39.43 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.2 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.51 
 
 
244 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.78 
 
 
208 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.43 
 
 
213 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
214 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.96 
 
 
232 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
192 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  39.88 
 
 
225 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.5 
 
 
217 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.3 
 
 
209 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.32 
 
 
222 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  34.1 
 
 
204 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.85 
 
 
217 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.95 
 
 
222 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  37.37 
 
 
207 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2056  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.7 
 
 
222 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000305808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.93 
 
 
202 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.32 
 
 
225 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.33 
 
 
201 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.89 
 
 
227 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.7 
 
 
222 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.7 
 
 
222 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.82 
 
 
233 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.92 
 
 
218 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.95 
 
 
218 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.13 
 
 
237 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.13 
 
 
237 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.13 
 
 
237 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.13 
 
 
237 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2103  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.7 
 
 
222 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  38.01 
 
 
211 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.32 
 
 
218 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.27 
 
 
222 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.68 
 
 
217 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  41.98 
 
 
206 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.13 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.13 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.13 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  38.01 
 
 
211 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.74 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.07 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.06 
 
 
199 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.89 
 
 
228 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.89 
 
 
228 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3691  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.65 
 
 
199 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.204228  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.89 
 
 
228 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.51 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.84 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.155081  normal  0.0228155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.46 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  42.11 
 
 
262 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3993  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 
184 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.1 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0064  ferric reductase domain-containing protein  43.66 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.39119  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.13 
 
 
224 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.79 
 
 
215 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3676  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.27 
 
 
199 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.60664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3641  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.27 
 
 
199 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.198888  hitchhiker  0.00058826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3570  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.27 
 
 
199 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.230846  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3569  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.27 
 
 
199 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000371311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2636  ferric reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
236 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.9823  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.96 
 
 
215 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.2 
 
 
236 aa  97.8  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1504  ferric reductase domain-containing protein  40.88 
 
 
227 aa  97.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180806  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3839  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.84 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0125482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0397  ferric reductase domain-containing protein  40.72 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0907023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>