138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3738 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3570  putative sulfite oxidase subunit YedZ  99.5 
 
 
199 aa  386  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.230846  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3676  putative sulfite oxidase subunit YedZ  99.5 
 
 
199 aa  386  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.60664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3569  putative sulfite oxidase subunit YedZ  99.5 
 
 
199 aa  386  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000371311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  100 
 
 
199 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.155081  normal  0.0228155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3641  putative sulfite oxidase subunit YedZ  98.99 
 
 
199 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.198888  hitchhiker  0.00058826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3691  putative sulfite oxidase subunit YedZ  85.93 
 
 
199 aa  328  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.204228  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  85.2 
 
 
211 aa  323  9e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  85.2 
 
 
211 aa  322  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  85.2 
 
 
211 aa  321  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  85.2 
 
 
211 aa  321  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  84.69 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  84.69 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  84.69 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  84.69 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  84.18 
 
 
211 aa  318  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3839  putative sulfite oxidase subunit YedZ  70.85 
 
 
199 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0125482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4415  putative sulfite oxidase subunit YedZ  70.35 
 
 
199 aa  271  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0107399  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0246  putative sulfite oxidase subunit YedZ  76.88 
 
 
199 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0256  putative sulfite oxidase subunit YedZ  76.38 
 
 
199 aa  260  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1202  putative sulfite oxidase subunit YedZ  72.82 
 
 
206 aa  247  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.701545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0461  putative sulfite oxidase subunit YedZ  72.82 
 
 
206 aa  247  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0394  putative sulfite oxidase subunit YedZ  72.91 
 
 
203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3681  putative sulfite oxidase subunit YedZ  71.07 
 
 
199 aa  234  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0572455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.35 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  49.25 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.49 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  43.65 
 
 
206 aa  165  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.71 
 
 
209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.72 
 
 
222 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.26 
 
 
213 aa  158  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2056  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.16 
 
 
222 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000305808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.16 
 
 
222 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.16 
 
 
222 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2103  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.6 
 
 
222 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.46 
 
 
208 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.49 
 
 
215 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3993  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
184 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1866  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.49 
 
 
215 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.139445  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.71 
 
 
209 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.81 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2233  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.93 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00590459  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2526  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.13 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2344  putative sulfite oxidase subunit YedZ  49.16 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.93 
 
 
220 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.93 
 
 
220 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2122  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.14 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.67 
 
 
220 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  41.45 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.3 
 
 
201 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1018  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.13 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.418777  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.79 
 
 
199 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.57 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.37 
 
 
214 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  35.56 
 
 
207 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0064  ferric reductase domain-containing protein  42.28 
 
 
208 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.39119  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.18 
 
 
202 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.04 
 
 
229 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.29 
 
 
213 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.64 
 
 
222 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.46 
 
 
197 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.46 
 
 
222 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  39.01 
 
 
217 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
192 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.46 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.46 
 
 
233 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.32 
 
 
232 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  35.59 
 
 
206 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.2 
 
 
217 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0986  hypothetical protein  41.42 
 
 
210 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3979  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.93 
 
 
200 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  30.51 
 
 
204 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3732  ferric reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
317 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
219 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.91 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.8 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.69 
 
 
225 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  37.16 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1411  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.18 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0078  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.18 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.883139  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0851  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.46 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000563409  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  39.86 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.16 
 
 
244 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.34 
 
 
237 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.64 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5405  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.33 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000422171  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  40.54 
 
 
219 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.36 
 
 
229 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1504  ferric reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
227 aa  95.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180806  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62100  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.5 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813375  hitchhiker  0.00458105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
233 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  35.38 
 
 
221 aa  94.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1258  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.1 
 
 
293 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  32.16 
 
 
214 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07340  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.62 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.533948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.82 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.99 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00213406  hitchhiker  0.0000892123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4539  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.02 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000898967  hitchhiker  0.00229075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3512  ferric reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
288 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0143111  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
224 aa  92.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>