138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1682 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  100 
 
 
215 aa  410  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  55.7 
 
 
183 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.27 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.55 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.28 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  40.98 
 
 
204 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.98 
 
 
218 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.33 
 
 
232 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.47 
 
 
229 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  41.8 
 
 
216 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.43 
 
 
244 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
219 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.78 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.78 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  46.78 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.58 
 
 
233 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  51.96 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  42.78 
 
 
213 aa  131  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.91 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.94 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  44.94 
 
 
237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.15 
 
 
222 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  48.88 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  43.62 
 
 
192 aa  127  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.64 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  44.9 
 
 
208 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  35.98 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.29 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  45.1 
 
 
262 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  43.79 
 
 
262 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  45.11 
 
 
210 aa  118  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2233  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.81 
 
 
215 aa  118  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00590459  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1866  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.81 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.139445  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  41.42 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2056  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.36 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000305808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  43.84 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  44.9 
 
 
219 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.16 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2103  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.8 
 
 
222 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  52.53 
 
 
206 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.87 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.87 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.8 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.8 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.21 
 
 
215 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.76 
 
 
209 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.67 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.52 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.14 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3993  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2856  ferric reductase domain-containing protein  40.78 
 
 
199 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.375369  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.13 
 
 
236 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
642 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.62 
 
 
207 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.11 
 
 
217 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.19 
 
 
220 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  43.6 
 
 
221 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  37.57 
 
 
207 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
237 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
237 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
237 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
237 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
241 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
241 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.22 
 
 
241 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.36 
 
 
201 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  37.07 
 
 
206 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.57 
 
 
199 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  35.85 
 
 
206 aa  101  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  42.47 
 
 
214 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  30.12 
 
 
209 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  36.51 
 
 
224 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  28.98 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2526  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.66 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.79 
 
 
197 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.82 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.47 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  38.51 
 
 
211 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  38.51 
 
 
211 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.5 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.1 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.41 
 
 
211 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2484  ferric reductase domain-containing protein  40.45 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757906  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.1 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.1 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.1 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.1 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.1 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2344  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.87 
 
 
203 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.49 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0986  hypothetical protein  43.43 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1504  ferric reductase domain-containing protein  41.73 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180806  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3732  ferric reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
317 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.66 
 
 
585 aa  92  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0851  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.31 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000563409  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3979  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.38 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.24 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.155081  normal  0.0228155 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>