141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0624 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  100 
 
 
202 aa  398  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.01 
 
 
199 aa  207  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  52.41 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1411  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.85 
 
 
201 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0078  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.85 
 
 
201 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.883139  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3979  putative sulfite oxidase subunit YedZ  50 
 
 
200 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  47.51 
 
 
220 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.07 
 
 
220 aa  167  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.07 
 
 
220 aa  167  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0064  ferric reductase domain-containing protein  52.57 
 
 
208 aa  157  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.39119  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  50.28 
 
 
217 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  45.71 
 
 
207 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.54 
 
 
213 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.23 
 
 
222 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.11 
 
 
218 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.45 
 
 
217 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  39.08 
 
 
204 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.7 
 
 
209 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  44 
 
 
218 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.23 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  43.33 
 
 
218 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.06 
 
 
214 aa  117  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.45 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.57 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.52 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
225 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.46 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.81 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  38.12 
 
 
216 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.06 
 
 
211 aa  111  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.06 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.06 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.06 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.06 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  37.99 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  37.99 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.54 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.43 
 
 
208 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.31 
 
 
237 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  40.34 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.25 
 
 
224 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.45 
 
 
229 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.45 
 
 
233 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  37.22 
 
 
219 aa  104  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.55 
 
 
227 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.15 
 
 
262 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  38.24 
 
 
215 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.81 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.17 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.93 
 
 
197 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  40.57 
 
 
206 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  40 
 
 
219 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
192 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3839  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.16 
 
 
199 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0125482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  40.67 
 
 
219 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.91 
 
 
232 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  37.37 
 
 
217 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.36 
 
 
213 aa  101  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.14 
 
 
204 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.08 
 
 
199 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.155081  normal  0.0228155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.18 
 
 
244 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3570  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.08 
 
 
199 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.230846  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3569  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.08 
 
 
199 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000371311  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3676  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.08 
 
 
199 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.60664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3641  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.19 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.198888  hitchhiker  0.00058826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
642 aa  99.4  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3691  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.2 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.204228  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  35.98 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  40.41 
 
 
262 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3993  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2925  ferric reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.365011  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  40.85 
 
 
206 aa  95.9  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0397  ferric reductase domain-containing protein  40.41 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0907023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.5 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3512  ferric reductase domain-containing protein  38.62 
 
 
288 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0143111  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.32 
 
 
585 aa  94.7  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  32.63 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  37.5 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2108  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
215 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181471  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1866  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.51 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.139445  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4539  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.31 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000898967  hitchhiker  0.00229075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  41.33 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4415  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.96 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0107399  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.91 
 
 
209 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2233  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.53 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00590459  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.97 
 
 
241 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.97 
 
 
241 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2043  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.53 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.97 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.97 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.78 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.97 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.97 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.97 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>