138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0706 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  59.68 
 
 
225 aa  222  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  58.85 
 
 
224 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.8 
 
 
232 aa  204  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.45 
 
 
217 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.8 
 
 
233 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.35 
 
 
229 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.7 
 
 
237 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.4 
 
 
244 aa  201  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.25 
 
 
233 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.14 
 
 
218 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  54.84 
 
 
218 aa  200  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.25 
 
 
228 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.25 
 
 
228 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.25 
 
 
228 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  55.25 
 
 
229 aa  197  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  57.69 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.04 
 
 
237 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.04 
 
 
237 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.04 
 
 
237 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.04 
 
 
237 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.04 
 
 
241 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.04 
 
 
241 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  56.04 
 
 
241 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  50 
 
 
222 aa  177  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  46.7 
 
 
219 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  50.79 
 
 
217 aa  164  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  46.7 
 
 
216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  43.09 
 
 
213 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  44.81 
 
 
204 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  47.06 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  47.65 
 
 
219 aa  151  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  55.48 
 
 
214 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  48.8 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  48.62 
 
 
227 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  44.97 
 
 
221 aa  144  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  47.4 
 
 
210 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0397  ferric reductase domain-containing protein  48.8 
 
 
241 aa  134  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0907023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  44.91 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.62 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.04 
 
 
220 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.04 
 
 
220 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.62 
 
 
215 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.78 
 
 
222 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.31 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.25 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  47.1 
 
 
183 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  45.51 
 
 
208 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.78 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.38 
 
 
217 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  36.26 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.23 
 
 
213 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.22 
 
 
585 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.71 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.91 
 
 
209 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  42.94 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.63 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  41.1 
 
 
262 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  42.77 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  39.67 
 
 
206 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0851  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.61 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000563409  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.36 
 
 
197 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0172  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  36.69 
 
 
294 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0986  hypothetical protein  38.18 
 
 
210 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.74 
 
 
203 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.16 
 
 
213 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3732  ferric reductase domain-containing protein  36.25 
 
 
317 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  39.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.24 
 
 
211 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  36.25 
 
 
225 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  39.24 
 
 
211 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  34.59 
 
 
215 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1504  ferric reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
227 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180806  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.67 
 
 
199 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2102  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.71 
 
 
207 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0694492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.61 
 
 
211 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0624  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.12 
 
 
202 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.85566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4539  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.36 
 
 
203 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000898967  hitchhiker  0.00229075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2636  ferric reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
236 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.9823  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  36.72 
 
 
214 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1258  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  34.76 
 
 
293 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1463  ferric reductase domain-containing protein  40.56 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00178479  normal  0.0312857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2344  putative sulfite oxidase subunit YedZ  33.33 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.92 
 
 
199 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.155081  normal  0.0228155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3641  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.08 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.198888  hitchhiker  0.00058826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3569  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.08 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000371311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2856  ferric reductase domain-containing protein  38.95 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.375369  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3676  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.08 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.60664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3570  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.08 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.230846  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.47 
 
 
209 aa  98.2  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  35.11 
 
 
642 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2103  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.76 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3839  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.65 
 
 
199 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0125482  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.22 
 
 
222 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>