136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3732 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3732  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1258  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  59.72 
 
 
293 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1636  ferric reductase domain-containing protein  60.59 
 
 
295 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3512  ferric reductase domain-containing protein  47 
 
 
288 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0143111  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2925  ferric reductase domain-containing protein  45.68 
 
 
285 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.365011  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0172  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  49.62 
 
 
294 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0537  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.6 
 
 
214 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0191676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0843  putative sulfite oxidase subunit YedZ  41.4 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  39.44 
 
 
213 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1008  ferric reductase-like transmembrane subunit  36.57 
 
 
204 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0221304  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1563  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.69 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.140464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2803  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.36 
 
 
237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10625  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  36.51 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  38.14 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01887  hypothetical protein  39.11 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000861435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01877  hypothetical protein  39.11 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000576969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40.22 
 
 
217 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1457  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.41 
 
 
222 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1892  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.88 
 
 
208 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770034  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.86 
 
 
211 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0350  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.52 
 
 
244 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2073  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.86 
 
 
211 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.68925e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2203  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.86 
 
 
211 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00810237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.86 
 
 
211 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00398621  normal  0.198757 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1679  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  38.86 
 
 
211 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3607  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.26 
 
 
232 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0127038  hitchhiker  0.000000030871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2751  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.29 
 
 
211 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.191385 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1367  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.88 
 
 
220 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1213  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.29 
 
 
211 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0027785  normal  0.48109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0303  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.71 
 
 
233 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0437  hypothetical protein  38.27 
 
 
217 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0706  ferric reductase domain-containing protein  36.25 
 
 
192 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3691  putative sulfite oxidase subunit YedZ  40 
 
 
199 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.204228  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0134  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.6 
 
 
199 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0171637  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  36.87 
 
 
222 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.46 
 
 
199 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.155081  normal  0.0228155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3876  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.61 
 
 
213 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0991  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.39 
 
 
220 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0933  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.39 
 
 
220 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3569  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.86 
 
 
199 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000371311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3570  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.86 
 
 
199 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.230846  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3676  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.86 
 
 
199 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.60664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0312  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.62 
 
 
229 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.31 
 
 
585 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0594  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.89 
 
 
208 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3140  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.29 
 
 
225 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3641  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.73 
 
 
199 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.198888  hitchhiker  0.00058826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1504  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  37.35 
 
 
183 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0285  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.16 
 
 
233 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0707437  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0363  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.97 
 
 
228 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2818  putative sulfite oxidase subunit YedZ  38.12 
 
 
201 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.216317  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3483  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.97 
 
 
229 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3976  hypothetical protein  38.71 
 
 
262 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.193582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2723  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.97 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1359  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.61 
 
 
218 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0423483  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0384  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.97 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3277  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.44 
 
 
224 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2980  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.43 
 
 
217 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.726094  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.43 
 
 
209 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4119  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40 
 
 
262 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2013  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.67 
 
 
215 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1012  putative sulfite oxidase subunit YedZ  37.28 
 
 
217 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0759  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.09 
 
 
204 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000056762  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0986  hypothetical protein  40.35 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199995  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2911  putative sulfite oxidase subunit YedZ  36.02 
 
 
218 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4673  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.91 
 
 
203 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140051  hitchhiker  0.000000915612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4675  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.32 
 
 
197 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0988  ferric reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
206 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707095  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01068  Ferric reductase-like transmembrane component  35 
 
 
225 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.290119  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  36.13 
 
 
219 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3032  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.54 
 
 
236 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
219 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3768  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.34 
 
 
241 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2757  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.34 
 
 
237 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.931978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3738  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.34 
 
 
237 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3195  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.34 
 
 
237 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1899  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.34 
 
 
237 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3710  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.34 
 
 
241 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3453  putative sulfite oxidase subunit YedZ  34.34 
 
 
241 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2500  putative sulfite oxidase subunit YedZ  32.04 
 
 
222 aa  92.4  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3258  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.4 
 
 
218 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378481  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1682  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  34.97 
 
 
215 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.364132  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0851  putative sulfite oxidase subunit YedZ  39.34 
 
 
210 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000563409  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2135  ferric reductase domain-containing protein  34.52 
 
 
214 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5585  ferric reductase domain-containing protein  40.13 
 
 
210 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.553247  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0620  hypothetical protein  34.03 
 
 
221 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.496074  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2412  putative sulfite oxidase subunit YedZ  30.73 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3839  putative sulfite oxidase subunit YedZ  35.08 
 
 
199 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0125482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1504  ferric reductase domain-containing protein  41.73 
 
 
227 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180806  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2618  putative sulfite oxidase subunit YedZ  30.05 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0914643  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0383  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.73 
 
 
207 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246088  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1982  putative sulfite oxidase subunit YedZ  30.69 
 
 
209 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  0.690265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2282  putative sulfite oxidase subunit YedZ  31.89 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00247521  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0577  ferric reductase domain-containing protein  31.38 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2526  putative sulfite oxidase subunit YedZ  29.63 
 
 
201 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4556  putative sulfite oxidase subunit YedZ  31.89 
 
 
222 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2270  putative sulfite oxidase subunit YedZ  31.89 
 
 
222 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00342161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2056  putative sulfite oxidase subunit YedZ  31.35 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000305808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0887  ferric reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
206 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000512451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2856  ferric reductase domain-containing protein  34.73 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.375369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>