151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0550 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  100 
 
 		 172 aa  340  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  79.75 
 
 		 168 aa  267  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  77.78 
 
 		 171 aa  264  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  76.58 
 
 		 180 aa  263  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  76.69 
 
 		 172 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  75.32 
 
 		 182 aa  260  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  75.61 
 
 		 179 aa  259  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  75.46 
 
 		 172 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  73.46 
 
 		 178 aa  258  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  73.01 
 
 		 181 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  69.59 
 
 		 177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  72.84 
 
 		 193 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  72.84 
 
 		 193 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  70.18 
 
 		 180 aa  250  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  69.82 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  69.82 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  69.82 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  72.22 
 
 		 193 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  72.22 
 
 		 193 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  72.22 
 
 		 193 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  72.22 
 
 		 193 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  71.34 
 
 		 176 aa  247  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  71.95 
 
 		 179 aa  246  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  72.5 
 
 		 182 aa  244  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  69.51 
 
 		 178 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  69.19 
 
 		 185 aa  243  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  72.73 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  69.94 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  69.94 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  71.7 
 
 		 174 aa  241  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  71.7 
 
 		 174 aa  241  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  71.7 
 
 		 174 aa  241  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  70.37 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  70.62 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  69.75 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  67.08 
 
 		 189 aa  238  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  63.69 
 
 		 188 aa  234  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  73.42 
 
 		 1238 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  67.95 
 
 		 184 aa  226  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  68.18 
 
 		 192 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  68.18 
 
 		 192 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  68.18 
 
 		 192 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  66.88 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  67.53 
 
 		 192 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  67.53 
 
 		 192 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  67.53 
 
 		 192 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  67.53 
 
 		 192 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  61.21 
 
 		 186 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  61.21 
 
 		 186 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  61.21 
 
 		 186 aa  207  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  59.06 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  54.67 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  54 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  54 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  54 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  54 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  56.29 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  54.55 
 
 		 183 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  48.57 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  44.1 
 
 		 190 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  44.51 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  43.93 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  46.86 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.86 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  46.86 
 
 		 177 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  44 
 
 		 191 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  44 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.29 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  43.29 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  43.04 
 
 		 181 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  43.04 
 
 		 181 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  47.2 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  46.47 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  46.45 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  47.2 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  45.83 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  47.62 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  47.62 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  41.57 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  43.12 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  44.91 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  44.91 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  44.91 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  44.91 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  44.91 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  45.34 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  44.31 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  42.33 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  44.31 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  42.11 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  40.79 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  41.28 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  41.28 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  41.28 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  41.28 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0438  hypothetical protein  47.79 
 
 		 141 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  36.63 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  35 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>