More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0783 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  100 
 
 		 495 aa  1011    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  67.56 
 
 		 484 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  65.83 
 
 		 475 aa  634  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  65.07 
 
 		 485 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  61.24 
 
 		 560 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  61.88 
 
 		 490 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  61.67 
 
 		 490 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  60.51 
 
 		 534 aa  594  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  59.76 
 
 		 541 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  59.76 
 
 		 541 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  62.53 
 
 		 485 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  60.44 
 
 		 556 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  60.33 
 
 		 485 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  59.56 
 
 		 541 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  60.64 
 
 		 565 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  60.44 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  60.28 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  61.88 
 
 		 485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  60.83 
 
 		 484 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  61.13 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  61.2 
 
 		 484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  60.04 
 
 		 481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  60.13 
 
 		 486 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  60.42 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  60 
 
 		 484 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  59.3 
 
 		 495 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  58.42 
 
 		 487 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  58.06 
 
 		 534 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  57.2 
 
 		 484 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  61.25 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  59.17 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  60.62 
 
 		 488 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  58.25 
 
 		 534 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  56.03 
 
 		 500 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  58.52 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  57.51 
 
 		 527 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  57.91 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  59.42 
 
 		 495 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  56.97 
 
 		 504 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  56.57 
 
 		 523 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  56.18 
 
 		 502 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  55.71 
 
 		 536 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  56.38 
 
 		 483 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  56.91 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  56.76 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  55.8 
 
 		 536 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  54.75 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  58.2 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  56.44 
 
 		 545 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  57.6 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  57.67 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  57.67 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  58.2 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  57.26 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  56.24 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  56.91 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  56.97 
 
 		 511 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  55.79 
 
 		 489 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  56.24 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  56.03 
 
 		 585 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  56.03 
 
 		 529 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  56.03 
 
 		 523 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  56.03 
 
 		 531 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  56.03 
 
 		 520 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.82 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.73 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  58.8 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  46.8 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.63 
 
 		 787 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  47.43 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.58 
 
 		 772 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  47.53 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.78 
 
 		 776 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  47.19 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  46.56 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  48.77 
 
 		 493 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  46.93 
 
 		 483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  45.96 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  46.99 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  48.05 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  48.98 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.49 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  48.77 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  46.72 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 532 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  45.34 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  43.78 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  45.47 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  46.64 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.09 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  47.11 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  42.48 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  45.36 
 
 		 492 aa  395  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  46.3 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  48.88 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  43.18 
 
 		 525 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  46.23 
 
 		 483 aa  392  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>