75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0719 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  590  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  59.72 
 
 
284 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  58.21 
 
 
285 aa  358  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  27.72 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  25.65 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  27.92 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  25.65 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.88 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.84 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  24.91 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  26.3 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  25.88 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  26.4 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  26.4 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  26.22 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  24 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  32.59 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  25.83 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.81 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  25.88 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  25.73 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  29.66 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  22.98 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  25.12 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  32.48 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  21.89 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  31.62 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  22.3 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  31.61 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  22.11 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  21.15 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  27.27 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  34.57 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  23.65 
 
 
354 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
347 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
347 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  36.25 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  23.94 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  20.49 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  31.87 
 
 
295 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  27.78 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  20.56 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.58 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 
534 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.35 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0473  hypothetical protein  25.45 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.67 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
272 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  24.58 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  25.27 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  19.31 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  23.79 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  34.74 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  33.8 
 
 
333 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  37.7 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
276 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  26 
 
 
324 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  31.11 
 
 
506 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>