More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1767 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  74.06 
 
 		 875 aa  1345    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  73.71 
 
 		 875 aa  1340    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  48.32 
 
 		 809 aa  788    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  56.21 
 
 		 857 aa  934    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  62.46 
 
 		 923 aa  1171    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  45.75 
 
 		 859 aa  778    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  45.17 
 
 		 815 aa  752    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  49.37 
 
 		 893 aa  842    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  65.89 
 
 		 860 aa  1171    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1202  DNA gyrase subunit A  44.9 
 
 		 900 aa  765    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  59.91 
 
 		 885 aa  1074    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  54.17 
 
 		 823 aa  899    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2331  DNA gyrase, A subunit  72.03 
 
 		 908 aa  1336    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.627723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1171  DNA gyrase subunit A  47.72 
 
 		 862 aa  762    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  47.55 
 
 		 819 aa  787    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  48.06 
 
 		 922 aa  815    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2411  DNA gyrase, A subunit  73.41 
 
 		 919 aa  1295    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  62.92 
 
 		 928 aa  1167    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  54.17 
 
 		 823 aa  899    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  54.17 
 
 		 823 aa  899    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  54.17 
 
 		 823 aa  900    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  60.9 
 
 		 866 aa  1066    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  65.97 
 
 		 863 aa  1181    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  65.89 
 
 		 863 aa  1179    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3647  DNA gyrase subunit A  63.95 
 
 		 925 aa  1164    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1543  DNA gyrase subunit A  55.05 
 
 		 930 aa  983    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  62.6 
 
 		 879 aa  1117    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  60.49 
 
 		 883 aa  1056    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0234  DNA gyrase subunit A  45.37 
 
 		 898 aa  775    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  51.21 
 
 		 949 aa  854    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  59.79 
 
 		 849 aa  1040    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  48.16 
 
 		 913 aa  811    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.85 
 
 		 872 aa  752    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  60.9 
 
 		 866 aa  1066    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  62.9 
 
 		 846 aa  1102    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  66.43 
 
 		 887 aa  1175    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  46.31 
 
 		 907 aa  785    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  54.55 
 
 		 835 aa  914    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  61.48 
 
 		 867 aa  1067    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  51.15 
 
 		 815 aa  830    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  51.24 
 
 		 828 aa  849    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  55.53 
 
 		 857 aa  926    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  49.58 
 
 		 811 aa  831    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  63.03 
 
 		 871 aa  1121    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  54.17 
 
 		 823 aa  899    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0640  DNA gyrase subunit A  49.1 
 
 		 827 aa  753    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00358145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  61.08 
 
 		 893 aa  1072    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  49.83 
 
 		 943 aa  834    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  49.34 
 
 		 814 aa  826    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  60.42 
 
 		 866 aa  1053    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4346  DNA gyrase subunit A  51.1 
 
 		 907 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  46.86 
 
 		 834 aa  754    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2876  DNA gyrase subunit A  48.96 
 
 		 925 aa  828    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.987294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1918  DNA gyrase subunit A  46.56 
 
 		 908 aa  794    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0264462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  48.17 
 
 		 839 aa  802    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0858  DNA gyrase subunit A  44.71 
 
 		 898 aa  776    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.683478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2494  DNA gyrase subunit A  45.57 
 
 		 919 aa  770    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  0.164499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  59.44 
 
 		 880 aa  1025    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2148  DNA gyrase subunit A  65.24 
 
 		 886 aa  1176    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0598325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  49.83 
 
 		 927 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  61.78 
 
 		 864 aa  1087    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  59.44 
 
 		 880 aa  1031    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  60.66 
 
 		 882 aa  1065    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  71.85 
 
 		 908 aa  1308    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  50.77 
 
 		 830 aa  843    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  48.84 
 
 		 917 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  65.67 
 
 		 907 aa  1204    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  48.18 
 
 		 913 aa  806    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1724  DNA gyrase, A subunit  54.95 
 
 		 928 aa  984    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0733273  normal  0.707795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  60.19 
 
 		 897 aa  1053    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0387  DNA gyrase, A subunit  67.81 
 
 		 847 aa  1210    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  47.95 
 
 		 865 aa  786    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  46.15 
 
 		 912 aa  767    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1164  DNA gyrase subunit A  46.33 
 
 		 901 aa  774    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.703676  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  61.84 
 
 		 867 aa  1069    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  46.92 
 
 		 852 aa  789    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2470  DNA gyrase, A subunit  73.41 
 
 		 897 aa  1330    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 		 929 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  49.23 
 
 		 865 aa  839    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  51.98 
 
 		 839 aa  891    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  52.09 
 
 		 839 aa  891    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  68.88 
 
 		 881 aa  1243    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1919  DNA gyrase subunit A  73.29 
 
 		 946 aa  1294    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000233211  hitchhiker  0.00000000296006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2059  DNA gyrase subunit A  73.29 
 
 		 944 aa  1293    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00127013  unclonable  0.0000452472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  66.9 
 
 		 862 aa  1164    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2130  DNA gyrase, A subunit  71.18 
 
 		 909 aa  1300    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.717755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  49.29 
 
 		 812 aa  816    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1873  DNA gyrase subunit A  46.14 
 
 		 946 aa  773    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  61.6 
 
 		 867 aa  1071    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  63.01 
 
 		 921 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  46.74 
 
 		 836 aa  793    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  47.27 
 
 		 866 aa  795    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  48.22 
 
 		 829 aa  798    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  47.94 
 
 		 848 aa  804    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  47.97 
 
 		 817 aa  795    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  61.84 
 
 		 867 aa  1071    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  49.34 
 
 		 796 aa  808    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  51.88 
 
 		 813 aa  858    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  55.36 
 
 		 915 aa  968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1972  DNA gyrase subunit A  73.29 
 
 		 918 aa  1294    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000455042  hitchhiker  0.000000817353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>