95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1180 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  100 
 
 
154 aa  310  6e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  36.43 
 
 
171 aa  75.1  3e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  34.4 
 
 
163 aa  75.1  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  34.4 
 
 
163 aa  75.1  3e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  34.4 
 
 
163 aa  75.1  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  34.4 
 
 
163 aa  75.1  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  40.34 
 
 
167 aa  74.3  5e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  33.07 
 
 
240 aa  74.3  6e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  72  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  33.33 
 
 
154 aa  72  3e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  32.28 
 
 
240 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  32.28 
 
 
240 aa  72  3e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  32.28 
 
 
240 aa  70.9  7e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  32.65 
 
 
154 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  31.9 
 
 
151 aa  69.3  2e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  32.2 
 
 
171 aa  68.2  4e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  27.91 
 
 
166 aa  67.4  7e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  67  8e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  30.25 
 
 
160 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  31.93 
 
 
172 aa  66.2  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  31.93 
 
 
172 aa  66.2  2e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  31.93 
 
 
172 aa  66.2  2e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  31.93 
 
 
172 aa  66.2  2e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  30.58 
 
 
158 aa  65.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  31.93 
 
 
172 aa  66.2  2e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  31.93 
 
 
179 aa  66.2  2e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  31.93 
 
 
191 aa  66.2  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  25.98 
 
 
154 aa  64.7  4e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.06 
 
 
170 aa  64.3  5e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  26.81 
 
 
168 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  32.43 
 
 
192 aa  62.4  2e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  25.36 
 
 
166 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  30.4 
 
 
168 aa  62  3e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  28.93 
 
 
180 aa  61.2  5e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  26.98 
 
 
162 aa  60.5  7e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  29.13 
 
 
197 aa  60.5  8e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.78046e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  29.75 
 
 
164 aa  60.5  8e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  25.35 
 
 
181 aa  60.5  8e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  31.78 
 
 
168 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  32.82 
 
 
178 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  28.23 
 
 
172 aa  59.3  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  28.23 
 
 
251 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  34.12 
 
 
172 aa  58.5  3e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  33.02 
 
 
176 aa  58.2  4e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  32.74 
 
 
163 aa  58.2  4e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  31.9 
 
 
166 aa  57.8  5e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  57  8e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  57  8e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  57  8e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  35 
 
 
167 aa  57  8e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.31 
 
 
156 aa  56.2  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  25 
 
 
180 aa  56.2  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  25.4 
 
 
179 aa  54.3  5e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  27.84 
 
 
180 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  27.5 
 
 
210 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  53.9  7e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  30.43 
 
 
177 aa  53.9  8e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.69 
 
 
172 aa  53.9  9e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  26.32 
 
 
163 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  31.96 
 
 
187 aa  53.1  1e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  29.08 
 
 
207 aa  52  3e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  38.24 
 
 
167 aa  51.6  4e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  38.24 
 
 
167 aa  51.6  4e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  38.24 
 
 
167 aa  51.6  4e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  23.7 
 
 
156 aa  51.2  5e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  30.93 
 
 
168 aa  49.3  2e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  29.55 
 
 
193 aa  49.7  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  4.78166e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  29.55 
 
 
193 aa  49.7  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  28.79 
 
 
193 aa  48.9  3e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  27.73 
 
 
186 aa  48.5  3e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  28.8 
 
 
199 aa  48.9  3e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  28.04 
 
 
179 aa  48.1  4e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  28.04 
 
 
179 aa  48.1  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  27.73 
 
 
155 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  30.1 
 
 
190 aa  48.1  5e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.71 
 
 
174 aa  47.8  6e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  26.92 
 
 
176 aa  47.8  6e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  28.23 
 
 
200 aa  47.4  7e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  27.42 
 
 
292 aa  47.4  7e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  28.23 
 
 
204 aa  47.4  8e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  28.23 
 
 
204 aa  47.4  8e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  28.23 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  26.24 
 
 
202 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  29.84 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.83 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  29.66 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  26.79 
 
 
203 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  27.48 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  27.48 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  28.26 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.98 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.03231e-07  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  28.23 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  27.42 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  3.51189e-05  normal  0.204022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>