More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0493 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  100 
 
 		 451 aa  901    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  80.93 
 
 		 452 aa  719    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  81.15 
 
 		 453 aa  722    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  80.49 
 
 		 451 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  63.03 
 
 		 454 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  62 
 
 		 455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  61.92 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  61.92 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  61.92 
 
 		 454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  60.36 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  61.02 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  60.98 
 
 		 453 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  60.58 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  60.44 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  60.58 
 
 		 454 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  60.14 
 
 		 454 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  60.36 
 
 		 454 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  60.36 
 
 		 454 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  60.14 
 
 		 454 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  61.33 
 
 		 454 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  57.08 
 
 		 452 aa  528  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  58.09 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  54.55 
 
 		 452 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  51.66 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  50.9 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  47.87 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  49.32 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  45.9 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  46.1 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  49.66 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  46.19 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  43.82 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  41.67 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  38.6 
 
 		 480 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  39.46 
 
 		 480 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  38.37 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  38.88 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  38.88 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  38.85 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  38.16 
 
 		 480 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.89 
 
 		 475 aa  325  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  38.62 
 
 		 480 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  38.16 
 
 		 480 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  41.49 
 
 		 494 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  38.82 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  37.93 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  39.07 
 
 		 481 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  36.79 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  36.79 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  36.79 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.32 
 
 		 492 aa  315  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  39.73 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  37.62 
 
 		 478 aa  312  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  39.08 
 
 		 480 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  37.77 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  36.82 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  38.81 
 
 		 471 aa  299  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  39.34 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  37.77 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  37.21 
 
 		 492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  37.5 
 
 		 492 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 446 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  38.39 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  37.35 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  37.97 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  37.11 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  35.93 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  37.14 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  34.67 
 
 		 481 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  37.98 
 
 		 462 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  37.23 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  38.39 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  36.79 
 
 		 478 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  37.91 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  34.16 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  37.38 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.29 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35.06 
 
 		 473 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  34.16 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  33.93 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  33.93 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.37 
 
 		 484 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  35.71 
 
 		 444 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  35.71 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  35.12 
 
 		 485 aa  262  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  35.62 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.81 
 
 		 445 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  34.83 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  37.24 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  34.83 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  34.83 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  34.54 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  34.83 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  35.84 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  32.96 
 
 		 445 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  35.48 
 
 		 479 aa  256  7e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  33.71 
 
 		 455 aa  256  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  34.44 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  34.87 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  36.43 
 
 		 459 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>