More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01300 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  95.57 
 
 
384 aa  740    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  100 
 
 
384 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  75.84 
 
 
379 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  69.61 
 
 
379 aa  532  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  66.84 
 
 
377 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  66.58 
 
 
377 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  65.54 
 
 
375 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  64.49 
 
 
377 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  63.97 
 
 
377 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  64.94 
 
 
376 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  65.54 
 
 
377 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  65.54 
 
 
377 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  64.32 
 
 
376 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  62.6 
 
 
402 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  63.28 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  60.52 
 
 
378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  63.28 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  61.62 
 
 
377 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  62.66 
 
 
376 aa  448  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  57.92 
 
 
378 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  57.55 
 
 
385 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  44.36 
 
 
374 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  44.36 
 
 
374 aa  316  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  48.4 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  48.16 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  45.34 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.63 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  40.98 
 
 
395 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.78 
 
 
392 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  39.24 
 
 
404 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  40.67 
 
 
375 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  38.92 
 
 
390 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  38.92 
 
 
390 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  34.01 
 
 
494 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.3 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  40.43 
 
 
404 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  41.67 
 
 
319 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  39.6 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  36.48 
 
 
462 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.65 
 
 
437 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  36.01 
 
 
431 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  38.6 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  37.84 
 
 
376 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  37.08 
 
 
383 aa  216  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  63.1 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  39.39 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  62.5 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  46.74 
 
 
467 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  46.05 
 
 
468 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  60.12 
 
 
481 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  36.83 
 
 
386 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  36.03 
 
 
390 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  35.38 
 
 
379 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  59.63 
 
 
488 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  62.5 
 
 
516 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.95 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  57.65 
 
 
687 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  60.71 
 
 
517 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  57.56 
 
 
492 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  57.8 
 
 
482 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  55.76 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  41.05 
 
 
483 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  37.02 
 
 
412 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  33 
 
 
386 aa  187  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
272 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
272 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
271 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
271 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  51.31 
 
 
271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  51.31 
 
 
271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  54.76 
 
 
492 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  53.45 
 
 
475 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  54.55 
 
 
493 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  52.87 
 
 
475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  55.83 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 
273 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  32.51 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  32.51 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  51.63 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  48.45 
 
 
501 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  53.29 
 
 
490 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  32.11 
 
 
388 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  54.32 
 
 
282 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  32.11 
 
 
388 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  32.11 
 
 
388 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  32.11 
 
 
388 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  56.29 
 
 
274 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  32.11 
 
 
388 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  32.11 
 
 
388 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  32.11 
 
 
388 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  52.17 
 
 
273 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.1 
 
 
276 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  59.62 
 
 
274 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  39.41 
 
 
492 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  55.69 
 
 
275 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  58.33 
 
 
272 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  55.9 
 
 
270 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  33.49 
 
 
420 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>