197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01298 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
396 aa  816  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  77.33 
 
 
397 aa  637  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  68.26 
 
 
397 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  60.2 
 
 
397 aa  517  1e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
401 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  29.68 
 
 
400 aa  184  2e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  28.32 
 
 
400 aa  183  5e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
396 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  29.13 
 
 
406 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  28.14 
 
 
396 aa  175  1e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  29.35 
 
 
402 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  30.07 
 
 
396 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  27.25 
 
 
401 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
402 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 
403 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  27.9 
 
 
403 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  28.82 
 
 
403 aa  166  6e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  27.65 
 
 
403 aa  166  6e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  27.65 
 
 
403 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.65 
 
 
403 aa  165  1e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  28.71 
 
 
400 aa  165  1e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.41 
 
 
403 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  26.82 
 
 
420 aa  156  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  27.4 
 
 
416 aa  148  2e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  25.45 
 
 
433 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 
401 aa  146  7e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  27.3 
 
 
400 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  26.98 
 
 
408 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.05 
 
 
400 aa  142  1e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.38 
 
 
411 aa  140  4e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.14 
 
 
411 aa  137  3e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  26.17 
 
 
401 aa  130  4e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  26.17 
 
 
401 aa  130  4e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  25.96 
 
 
412 aa  128  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  27.65 
 
 
405 aa  128  2e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.13698e-06 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  23.57 
 
 
439 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.23 
 
 
410 aa  127  4e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  26.19 
 
 
410 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
410 aa  121  2e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
410 aa  121  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
410 aa  121  2e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
410 aa  121  2e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  32.63 
 
 
562 aa  121  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
410 aa  121  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
410 aa  121  2e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
410 aa  121  2e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  24.7 
 
 
404 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  26.44 
 
 
404 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  25.31 
 
 
403 aa  118  2e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
410 aa  115  2e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  23.89 
 
 
399 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  28.04 
 
 
530 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  24.81 
 
 
406 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
521 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  28.34 
 
 
524 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3573  flagellar hook-associated protein 3  23.37 
 
 
436 aa  96.3  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  23.97 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  22.98 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
523 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  22.75 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  22.52 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  22.17 
 
 
411 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  22.17 
 
 
411 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  26.64 
 
 
530 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  29.35 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  28.34 
 
 
520 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
326 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  23.3 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  29.48 
 
 
305 aa  86.3  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  24.21 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  27.72 
 
 
299 aa  85.1  2e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  27.6 
 
 
302 aa  84.7  2e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  21.41 
 
 
413 aa  84.3  3e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  23.26 
 
 
410 aa  84.7  3e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  32.07 
 
 
312 aa  84.3  3e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  23.73 
 
 
407 aa  84  5e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  21.65 
 
 
413 aa  83.6  6e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
326 aa  83.2  8e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
326 aa  83.2  8e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  29.53 
 
 
292 aa  82.4  1e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  27.42 
 
 
532 aa  82.4  1e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  26.74 
 
 
521 aa  82.8  1e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0073  flagellar hook-associated protein 3 FlgL  21.84 
 
 
409 aa  82.8  1e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  26.67 
 
 
248 aa  82.4  1e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  21.43 
 
 
420 aa  81.6  2e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
317 aa  81.3  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
317 aa  81.3  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
317 aa  81.3  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.79805e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
317 aa  81.3  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01663e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
317 aa  81.3  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  21.23 
 
 
420 aa  80.9  4e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  30.16 
 
 
319 aa  80.5  5e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  27.95 
 
 
317 aa  79.7  9e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
300 aa  79.3  1e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
317 aa  79.3  1e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1709  flagellar hook-associated protein 3  21.59 
 
 
409 aa  79  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.0295245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  29.94 
 
 
310 aa  78.2  2e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  27.95 
 
 
317 aa  78.2  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  27.95 
 
 
317 aa  78.2  3e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  27.57 
 
 
305 aa  77.8  3e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>