More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1475 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  61.52 
 
 
524 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
521 aa  1048    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  54.77 
 
 
523 aa  571  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  49.43 
 
 
521 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  45.63 
 
 
530 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  46.2 
 
 
530 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  48.28 
 
 
520 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  38.26 
 
 
562 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  36.77 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  35.45 
 
 
433 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  37.7 
 
 
410 aa  126  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.13 
 
 
408 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  32.56 
 
 
407 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  32.43 
 
 
407 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  37.5 
 
 
300 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  35.52 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  34.64 
 
 
305 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  34.43 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  34.43 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
396 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.81 
 
 
400 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  30.38 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  36.07 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  33.88 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  29.87 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  30.56 
 
 
413 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  29.74 
 
 
400 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.21 
 
 
408 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  30.94 
 
 
305 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  28.42 
 
 
400 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  32.75 
 
 
396 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
410 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 
401 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 
404 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
410 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
410 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
410 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
410 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
410 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
410 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
410 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
413 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  33.33 
 
 
400 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
411 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  31.42 
 
 
404 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.67 
 
 
401 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.76 
 
 
401 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.76 
 
 
401 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  32.07 
 
 
299 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  33.15 
 
 
299 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  27.6 
 
 
402 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  34.41 
 
 
396 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  30.17 
 
 
305 aa  103  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  27.68 
 
 
400 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 
411 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 
411 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  27.56 
 
 
402 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  30 
 
 
532 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  28.43 
 
 
305 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  26.16 
 
 
403 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
403 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
403 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
403 aa  97.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  30.72 
 
 
305 aa  97.1  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  26.65 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
403 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  26.96 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  30.24 
 
 
305 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 
305 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  25.97 
 
 
401 aa  94.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  28.96 
 
 
297 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  32.24 
 
 
248 aa  93.6  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
403 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  31.66 
 
 
326 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
326 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  34.24 
 
 
304 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  31.18 
 
 
302 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
326 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  34.05 
 
 
311 aa  91.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  29.57 
 
 
312 aa  91.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  31.41 
 
 
316 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  28.68 
 
 
405 aa  90.5  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  28.72 
 
 
406 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  30.21 
 
 
398 aa  89.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  26.74 
 
 
396 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  28.88 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  31.02 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  35 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  30.36 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  34.16 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.68 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  30.2 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  33.68 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  32.88 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>