191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004163 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
397 aa  822    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  77.33 
 
 
396 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  70.53 
 
 
397 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  60.45 
 
 
397 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  31.77 
 
 
401 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  30.5 
 
 
396 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  30.66 
 
 
406 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  31.51 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  31.27 
 
 
403 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  31.27 
 
 
403 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
401 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
400 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  31.76 
 
 
403 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  31.47 
 
 
403 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  31.27 
 
 
403 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  30.27 
 
 
402 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  31.02 
 
 
403 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  30.4 
 
 
396 aa  186  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  29.6 
 
 
402 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
396 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  29.32 
 
 
400 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 
416 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  27.79 
 
 
420 aa  162  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  28.15 
 
 
400 aa  159  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  26.8 
 
 
400 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  26.76 
 
 
433 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.01 
 
 
400 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  28.22 
 
 
401 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  27.34 
 
 
408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.17 
 
 
411 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  27.49 
 
 
410 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  26.67 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.4 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  26.42 
 
 
401 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  26.42 
 
 
401 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  25.79 
 
 
410 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  25.93 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  35.26 
 
 
562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.1 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  25.06 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3573  flagellar hook-associated protein 3  24.94 
 
 
436 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  22.36 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
439 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  29.95 
 
 
530 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  23.24 
 
 
411 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  23.51 
 
 
399 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 
408 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  22.57 
 
 
411 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  22.57 
 
 
411 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  28.88 
 
 
521 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  23.53 
 
 
406 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  24.17 
 
 
413 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  32.37 
 
 
305 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.12 
 
 
524 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  24.76 
 
 
410 aa  99.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  23 
 
 
411 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  23.26 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  30.64 
 
 
305 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
530 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  29.67 
 
 
520 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  22.59 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.88 
 
 
521 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  30.4 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  28.1 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  26.74 
 
 
523 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  22.22 
 
 
398 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 
302 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  26.47 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  21.43 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  21.67 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  32.69 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  21.33 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.08 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  25.53 
 
 
532 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  29.74 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  25.27 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0073  flagellar hook-associated protein 3 FlgL  22.31 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  30.73 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  27.66 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  27.78 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  26.32 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  22 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  22.63 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  22.04 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>