162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003127 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  100 
 
 		 513 aa  1061    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  83.46 
 
 		 530 aa  902    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  43.16 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  37.84 
 
 		 513 aa  335  7.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  35.67 
 
 		 606 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  35.04 
 
 		 615 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  34.8 
 
 		 512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  34.84 
 
 		 615 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  35.85 
 
 		 576 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  34.65 
 
 		 615 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  35.66 
 
 		 564 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  35.67 
 
 		 563 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  34.65 
 
 		 607 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  34.38 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  33.57 
 
 		 615 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  33.57 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  33.57 
 
 		 615 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  33.57 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  33.57 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  33.57 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  33.57 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  34.44 
 
 		 611 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  34.81 
 
 		 575 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  45.08 
 
 		 618 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  45.08 
 
 		 618 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  45.08 
 
 		 596 aa  276  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  44.71 
 
 		 613 aa  270  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 559 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  38.98 
 
 		 563 aa  230  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.26 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 560 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.92 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.42 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.81 
 
 		 566 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.8 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 563 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.51 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.88 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 521 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 458 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  28.41 
 
 		 546 aa  210  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.88 
 
 		 521 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.78 
 
 		 560 aa  209  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.59 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.11 
 
 		 525 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.98 
 
 		 473 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  34.03 
 
 		 530 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.51 
 
 		 547 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  37.86 
 
 		 563 aa  203  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 465 aa  203  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  38.65 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.16 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.63 
 
 		 558 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1072  hypothetical protein  43.44 
 
 		 475 aa  199  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.92 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.08 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 472 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  36.68 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 544 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.46 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.2 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.18 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  35.73 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  36.98 
 
 		 536 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  38.31 
 
 		 546 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.31 
 
 		 546 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  28.06 
 
 		 571 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.91 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  35 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.49 
 
 		 556 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  26.32 
 
 		 568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 560 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  35.76 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.23 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  34.66 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  33.11 
 
 		 558 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.2 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  35.52 
 
 		 661 aa  170  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.76 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.45 
 
 		 478 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.83 
 
 		 553 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.66 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.38 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.38 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  34.43 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.33 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.39 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  33.68 
 
 		 631 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  29.08 
 
 		 811 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.59 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.47 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 525 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>